Protein–RNA interactions for Protein: O15484

CAPN5, Calpain-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN5O15484 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN5O15484 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CAPN5O15484 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CAPN5O15484 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms