Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHADO15335 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHADO15335 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHADO15335 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHADO15335 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHADO15335 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHADO15335 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHADO15335 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHADO15335 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHADO15335 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHADO15335 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHADO15335 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHADO15335 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHADO15335 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHADO15335 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHADO15335 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHADO15335 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHADO15335 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHADO15335 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHADO15335 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHADO15335 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHADO15335 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHADO15335 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHADO15335 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHADO15335 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHADO15335 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHADO15335 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHADO15335 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHADO15335 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHADO15335 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHADO15335 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHADO15335 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHADO15335 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHADO15335 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHADO15335 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHADO15335 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHADO15335 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHADO15335 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHADO15335 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHADO15335 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms