Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EPHB6O15197 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPHB6O15197 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPHB6O15197 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms