Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VWA5AO00534 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VWA5AO00534 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWA5AO00534 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms