Protein–RNA interactions for Protein: O00501

CLDN5, Claudin-5, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5O00501 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN5O00501 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN5O00501 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN5O00501 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms