Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE2AO00408 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
PDE2AO00408 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE2AO00408 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms