Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDC7O00311 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC7O00311 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC7O00311 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC7O00311 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC7O00311 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC7O00311 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC7O00311 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC7O00311 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC7O00311 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC7O00311 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC7O00311 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC7O00311 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC7O00311 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC7O00311 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC7O00311 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC7O00311 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC7O00311 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC7O00311 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC7O00311 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDC7O00311 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDC7O00311 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC7O00311 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC7O00311 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC7O00311 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC7O00311 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC7O00311 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC7O00311 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDC7O00311 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC7O00311 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC7O00311 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC7O00311 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC7O00311 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC7O00311 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC7O00311 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC7O00311 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms