Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QRE1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QRE1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QRE1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QRE1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QRE1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QRE1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3QRE1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3QRE1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QRE1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QRE1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QRE1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3QRE1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
J3QRE1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
J3QRE1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
J3QRE1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
J3QRE1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QRE1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QRE1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QRE1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QRE1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QRE1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QRE1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
J3QRE1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
J3QRE1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
J3QRE1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
J3QRE1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
J3QRE1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QRE1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QRE1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QRE1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QRE1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
J3QRE1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
J3QRE1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
J3QRE1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
J3QRE1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
J3QRE1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms