Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KRW8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KRW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KRW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KRW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KRW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
J3KRW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
J3KRW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
J3KRW8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3KRW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3KRW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3KRW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3KRW8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3KRW8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3KRW8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
J3KRW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
J3KRW8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
J3KRW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
J3KRW8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
J3KRW8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
J3KRW8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms