Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMKR1H3BMG3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMKR1H3BMG3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms