Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H3BM21 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BM21 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BM21 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BM21 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BM21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BM21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H3BM21 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H3BM21 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BM21 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BM21 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BM21 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BM21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BM21 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H3BM21 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BM21 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BM21 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BM21 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H3BM21 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BM21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BM21 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BM21 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BM21 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BM21 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BM21 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
H3BM21 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BM21 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BM21 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BM21 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BM21 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BM21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
H3BM21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H3BM21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BM21 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BM21 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BM21 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BM21 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BM21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H3BM21 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BM21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BM21 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BM21 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BM21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BM21 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H3BM21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
H3BM21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BM21 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BM21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BM21 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BM21 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H3BM21 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BM21 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BM21 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BM21 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BM21 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BM21 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H3BM21 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H3BM21 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H3BM21 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms