Protein–RNA interactions for Protein: F8VWA3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VWA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F8VWA3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F8VWA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8VWA3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8VWA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8VWA3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8VWA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F8VWA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
F8VWA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
F8VWA3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
F8VWA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F8VWA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
F8VWA3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F8VWA3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
F8VWA3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
F8VWA3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
F8VWA3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
F8VWA3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
F8VWA3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
F8VWA3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
F8VWA3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
F8VWA3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms