Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP17L12C9JPN9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP17L12C9JPN9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP17L12C9JPN9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP17L12C9JPN9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms