Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF487B1APH4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF487B1APH4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF487B1APH4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms