Protein–RNA interactions for Protein: A8MXK1

VSTM5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM5A8MXK1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSTM5A8MXK1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VSTM5A8MXK1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms