Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP27XA6NNY8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP27XA6NNY8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP27XA6NNY8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms