Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRRM3A6NNA2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SRRM3A6NNA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRM3A6NNA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms