Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HELTA6NFD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HELTA6NFD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HELTA6NFD8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms