Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM247A6NEH6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM247A6NEH6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms