Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GMNCA6NCL1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GMNCA6NCL1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GMNCA6NCL1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms