Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIPSLA2A3N6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPSLA2A3N6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIPSLA2A3N6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms