Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBA6A0AVT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBA6A0AVT1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBA6A0AVT1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms