Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCRBV5S2A0A599 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCRBV5S2A0A599 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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TCRBV5S2A0A599 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TCRBV5S2A0A599 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TCRBV5S2A0A599 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TCRBV5S2A0A599 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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