Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0U1RQJ8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0U1RQJ8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0U1RQJ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms