Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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