Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYH1

C15orf38-AP3S2, Protein C15orf38-AP3S2, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms