Protein–RNA interactions for Protein: Q99252

ECM3, Protein ECM3, yeastyeast

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM3Q99252 RPP2AYOL039W 321 nt13.1□□□□□ -0.31
ECM3Q99252 DCW1YKL046C 1350 nt13.07□□□□□ -0.32
ECM3Q99252 PTP1YDL230W 1008 nt13.07□□□□□ -0.32
ECM3Q99252 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.07□□□□□ -0.32
ECM3Q99252 PUS2YGL063W 1113 nt13.03□□□□□ -0.32
ECM3Q99252 TIR4YOR009W 1464 nt12.97□□□□□ -0.33
ECM3Q99252 YJL152WYJL152W 360 nt12.96□□□□□ -0.33
ECM3Q99252 ART5YGR068C 1761 nt12.96□□□□□ -0.34
ECM3Q99252 CAC2YML102W 1407 nt12.96□□□□□ -0.34
ECM3Q99252 SSA4YER103W 1929 nt12.93□□□□□ -0.34
ECM3Q99252 EMI2YDR516C 1503 nt12.9□□□□□ -0.34
ECM3Q99252 YCH1YGR203W 447 nt12.9□□□□□ -0.34
ECM3Q99252 GFD2YCL036W 1701 nt12.9□□□□□ -0.34
ECM3Q99252 PET9YBL030C 957 nt12.85□□□□□ -0.35
ECM3Q99252 DSK2YMR276W 1122 nt12.84□□□□□ -0.35
ECM3Q99252 YLR236CYLR236C 324 nt12.83□□□□□ -0.36
ECM3Q99252 YPR011CYPR011C 981 nt12.83□□□□□ -0.36
ECM3Q99252 YMR057CYMR057C 372 nt12.82□□□□□ -0.36
ECM3Q99252 YDL221WYDL221W 552 nt12.81□□□□□ -0.36
ECM3Q99252 IMP2'YIL154C 1041 nt12.77□□□□□ -0.37
ECM3Q99252 RTS2YOR077W 699 nt12.77□□□□□ -0.37
ECM3Q99252 IRC15YPL017C 1500 nt12.77□□□□□ -0.37
ECM3Q99252 YMR090WYMR090W 684 nt12.75□□□□□ -0.37
ECM3Q99252 FMP45YDL222C 930 nt12.72□□□□□ -0.37
ECM3Q99252 IDH1YNL037C 1083 nt12.72□□□□□ -0.37
ECM3Q99252 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.68□□□□□ -0.38
ECM3Q99252 GIS3YLR094C 1509 nt12.67□□□□□ -0.38
ECM3Q99252 FPS1YLL043W 2010 nt12.64□□□□□ -0.39
ECM3Q99252 YBR220CYBR220C 1683 nt12.64□□□□□ -0.39
ECM3Q99252 SDH1YKL148C 1923 nt12.63□□□□□ -0.39
ECM3Q99252 GBP2YCL011C 1284 nt12.63□□□□□ -0.39
ECM3Q99252 LPX1YOR084W 1164 nt12.61□□□□□ -0.39
ECM3Q99252 MOT3YMR070W 1473 nt12.6□□□□□ -0.39
ECM3Q99252 CUE1YMR264W 612 nt12.6□□□□□ -0.39
ECM3Q99252 YDR433WYDR433W 441 nt12.58□□□□□ -0.4
ECM3Q99252 SCC4YER147C 1875 nt12.57□□□□□ -0.4
ECM3Q99252 ERV46YAL042W 1248 nt12.56□□□□□ -0.4
ECM3Q99252 MXR2YCL033C 507 nt12.52□□□□□ -0.41
ECM3Q99252 TCD2YKL027W 1344 nt12.47□□□□□ -0.41
ECM3Q99252 RRD1YIL153W 1182 nt12.46□□□□□ -0.41
ECM3Q99252 YKR040CYKR040C 504 nt12.46□□□□□ -0.41
ECM3Q99252 DED1YOR204W 1815 nt12.45□□□□□ -0.42
ECM3Q99252 YIL100WYIL100W 354 nt12.44□□□□□ -0.42
ECM3Q99252 BDF1YLR399C 2061 nt12.41□□□□□ -0.42
ECM3Q99252 SPP1YPL138C 1062 nt12.39□□□□□ -0.43
ECM3Q99252 FMT1YBL013W 1206 nt12.33□□□□□ -0.44
ECM3Q99252 FRD1YEL047C 1413 nt12.28□□□□□ -0.44
ECM3Q99252 YSC84YHR016C 1407 nt12.28□□□□□ -0.44
ECM3Q99252 Q0182Q0182 405 nt12.27□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 RRT12YCR045C 1476 nt12.27□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 TAT1YBR069C 1860 nt12.26□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 FMP52YER004W 696 nt12.25□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 YNL195CYNL195C 786 nt12.24□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 SOR2YDL246C 1074 nt12.23□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 SOR1YJR159W 1074 nt12.23□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 YHL050CYHL050C 2094 nt12.22□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 YCL042WYCL042W 360 nt12.22□□□□□ -0.45
ECM3Q99252 CWP1YKL096W 720 nt12.2□□□□□ -0.46
ECM3Q99252 ADH2YMR303C 1047 nt12.18□□□□□ -0.46
ECM3Q99252 PCM1YEL058W 1674 nt12.13□□□□□ -0.47
ECM3Q99252 SEC11YIR022W 504 nt12.13□□□□□ -0.47
ECM3Q99252 RTG1YOL067C 534 nt12.12□□□□□ -0.47
ECM3Q99252 PTH1YHR189W 573 nt12.1□□□□□ -0.47
ECM3Q99252 PCH2YBR186W 1695 nt12.07□□□□□ -0.48
ECM3Q99252 SNF6YHL025W 999 nt12.06□□□□□ -0.48
ECM3Q99252 MRPL8YJL063C 717 nt12.06□□□□□ -0.48
ECM3Q99252 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.05□□□□□ -0.48
ECM3Q99252 YEL076CYEL076C 651 nt12.05□□□□□ -0.48
ECM3Q99252 YLR464WYLR464W 651 nt12.05□□□□□ -0.48
ECM3Q99252 GUT2YIL155C 1950 nt12□□□□□ -0.49
ECM3Q99252 YLR235CYLR235C 399 nt11.99□□□□□ -0.49
ECM3Q99252 DIC1YLR348C 897 nt11.96□□□□□ -0.49
ECM3Q99252 LCB1YMR296C 1677 nt11.95□□□□□ -0.5
ECM3Q99252 ADO1YJR105W 1023 nt11.95□□□□□ -0.5
ECM3Q99252 SIM1YIL123W 1431 nt11.94□□□□□ -0.5
ECM3Q99252 YIH1YCR059C 777 nt11.94□□□□□ -0.5
ECM3Q99252 YKL030WYKL030W 606 nt11.94□□□□□ -0.5
ECM3Q99252 BIO4YNR057C 714 nt11.93□□□□□ -0.5
ECM3Q99252 RNQ1YCL028W 1218 nt11.93□□□□□ -0.5
ECM3Q99252 HUA1YGR268C 597 nt11.87□□□□□ -0.51
ECM3Q99252 TIM23YNR017W 669 nt11.87□□□□□ -0.51
ECM3Q99252 NCP1YHR042W 2076 nt11.87□□□□□ -0.51
ECM3Q99252 YLL053CYLL053C 459 nt11.86□□□□□ -0.51
ECM3Q99252 PIB2YGL023C 1908 nt11.86□□□□□ -0.51
ECM3Q99252 RTF1YGL244W 1677 nt11.83□□□□□ -0.52
ECM3Q99252 YLR179CYLR179C 606 nt11.81□□□□□ -0.52
ECM3Q99252 BOP3YNL042W 1191 nt11.81□□□□□ -0.52
ECM3Q99252 FTR1YER145C 1215 nt11.77□□□□□ -0.53
ECM3Q99252 GAL1YBR020W 1587 nt11.74□□□□□ -0.53
ECM3Q99252 TRM5YHR070W 1500 nt11.71□□□□□ -0.53
ECM3Q99252 WSC2YNL283C 1512 nt11.71□□□□□ -0.53
ECM3Q99252 ERF2YLR246W 1080 nt11.7□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 ATF2YGR177C 1608 nt11.7□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 YPR064WYPR064W 420 nt11.69□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 LYS4YDR234W 2082 nt11.69□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 AHT1YHR093W 549 nt11.68□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 CRR1YLR213C 1269 nt11.68□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 AQY1YPR192W 918 nt11.67□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 PTK1YKL198C 1989 nt11.67□□□□□ -0.54
ECM3Q99252 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms