Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ6

GEMIN5, Gem-associated protein 5, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN5Q8TEQ6 B2M-210ENST00000560681 572 ntTSL 425.49■■□□□ 1.671e-14■■■■■ 95.4
GEMIN5Q8TEQ6 B2M-207ENST00000559907 499 ntTSL 322.96■■□□□ 1.271e-14■■■■■ 95.4
GEMIN5Q8TEQ6 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC3.64□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 94
GEMIN5Q8TEQ6 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC8.21□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 90.3
GEMIN5Q8TEQ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.1■■■□□ 2.576e-12■■■■■ 82.6
GEMIN5Q8TEQ6 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.941e-323■■■■■ 81.6
GEMIN5Q8TEQ6 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.17e-10■■■■■ 81.2
GEMIN5Q8TEQ6 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 225.8■■□□□ 1.722e-8■■■■■ 80.9
GEMIN5Q8TEQ6 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 80.9
GEMIN5Q8TEQ6 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 80.9
GEMIN5Q8TEQ6 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 80.9
GEMIN5Q8TEQ6 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 80.9
GEMIN5Q8TEQ6 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 310.38□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 80.9
GEMIN5Q8TEQ6 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 519.87■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 80.2
GEMIN5Q8TEQ6 U1.27-201ENST00000615842 164 ntBASIC13.32□□□□□ -0.281e-323■■■■■ 78.8
GEMIN5Q8TEQ6 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.763e-23■■■■■ 78.7
GEMIN5Q8TEQ6 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.383e-23■■■■■ 78.7
GEMIN5Q8TEQ6 LINC01138-207ENST00000638958 1395 ntTSL 528.73■■■□□ 2.191e-8■■■■■ 77.7
GEMIN5Q8TEQ6 LINC01138-210ENST00000640832 1709 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.531e-8■■■■■ 77.7
GEMIN5Q8TEQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.443e-7■■■■■ 76.8
GEMIN5Q8TEQ6 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.553e-7■■■■■ 76.8
GEMIN5Q8TEQ6 U2AF1-206ENST00000464750 966 ntTSL 1 (best)42.34■■■■■ 4.379e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.279e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.179e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.739e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 U2AF1-211ENST00000486519 682 ntTSL 326.59■■□□□ 1.859e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC17.49■□□□□ 0.399e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 U2AF1-209ENST00000475639 4694 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.319e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 U2AF1-212ENST00000496462 3973 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.389e-12■■■■■ 76.3
GEMIN5Q8TEQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.578e-14■■■■■ 76.1
GEMIN5Q8TEQ6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.378e-14■■■■■ 76.1
GEMIN5Q8TEQ6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.338e-14■■■■■ 76.1
GEMIN5Q8TEQ6 NEURL4-206ENST00000571887 4291 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.18■□□□□ 0.668e-14■■■■■ 76.1
GEMIN5Q8TEQ6 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 217.15■□□□□ 0.341e-10■■■■■ 75.7
GEMIN5Q8TEQ6 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-10■■■■■ 75.7
GEMIN5Q8TEQ6 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.532e-90■■■■■ 75.6
GEMIN5Q8TEQ6 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.095e-10■■■■■ 75.1
GEMIN5Q8TEQ6 AL669831.3-208ENST00000634337 891 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 74
GEMIN5Q8TEQ6 AL669831.3-207ENST00000635509 941 ntTSL 515.05■□□□□ -06e-7■■■■■ 74
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.36e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-207ENST00000565195 586 ntTSL 227.42■■□□□ 1.986e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-205ENST00000562509 564 ntTSL 227.26■■□□□ 1.956e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-212ENST00000569244 557 ntTSL 426.39■■□□□ 1.816e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.746e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-203ENST00000561574 577 ntTSL 424.56■■□□□ 1.526e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.456e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.436e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-206ENST00000562649 557 ntTSL 523.44■■□□□ 1.346e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.266e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 ARVCF-205ENST00000462319 433 ntTSL 322.88■■□□□ 1.256e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.256e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-213ENST00000569319 1643 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.26e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.166e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.046e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 16e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-208ENST00000566167 551 ntTSL 520.58■□□□□ 0.896e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.756e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.566e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.476e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 AC012184.2-201ENST00000565116 565 ntTSL 516.21■□□□□ 0.196e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-201ENST00000302243 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.186e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 DDX19A-214ENST00000569771 3067 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.026e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 AC012184.2-202ENST00000567706 867 ntTSL 514.77□□□□□ -0.046e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.566e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.276e-9■■■■■ 73.8
GEMIN5Q8TEQ6 EDEM1-205ENST00000465187 585 ntTSL 435.84■■■■□ 3.335e-11■■■■■ 71.6
GEMIN5Q8TEQ6 KMT5A-206ENST00000462311 747 ntTSL 534.26■■■■□ 3.085e-11■■■■■ 71.6
GEMIN5Q8TEQ6 EDEM1-206ENST00000465369 1956 ntTSL 533.93■■■■□ 3.025e-11■■■■■ 71.6
GEMIN5Q8TEQ6 EDEM1-203ENST00000443790 730 ntTSL 232.99■■■□□ 2.875e-11■■■■■ 71.6
GEMIN5Q8TEQ6 EDEM1-202ENST00000434243 978 ntTSL 221.69■■□□□ 1.065e-11■■■■■ 71.6
GEMIN5Q8TEQ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.715e-11■■■■■ 71.6
GEMIN5Q8TEQ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.855e-16■■■■■ 70.1
GEMIN5Q8TEQ6 FNTA-210ENST00000533336 874 ntTSL 311.04□□□□□ -0.645e-16■■■■■ 70.1
GEMIN5Q8TEQ6 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.43□□□□□ -2.345e-16■■■■■ 70.1
GEMIN5Q8TEQ6 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 67.6
GEMIN5Q8TEQ6 MIR210-201ENST00000362168 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.269e-64■■■■■ 67.2
GEMIN5Q8TEQ6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.813e-6■■■■■ 67.1
GEMIN5Q8TEQ6 LCP1-204ENST00000442275 753 ntTSL 334.31■■■■□ 3.083e-10■■■■■ 66.8
GEMIN5Q8TEQ6 RNU1-3-201ENST00000384782 164 ntBASIC13.32□□□□□ -0.283e-10■■■■■ 66.8
GEMIN5Q8TEQ6 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 66.8
GEMIN5Q8TEQ6 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.863e-10■■■■■ 66.8
GEMIN5Q8TEQ6 LCP1-205ENST00000460190 765 ntTSL 29.26□□□□□ -0.933e-10■■■■■ 66.8
GEMIN5Q8TEQ6 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.718e-7■■■■■ 66.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSMB3-207ENST00000610434 510 ntTSL 318.08■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 66.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSMB3-208ENST00000613870 662 ntTSL 313.05□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 66.5
GEMIN5Q8TEQ6 PSMB3-212ENST00000620309 552 ntTSL 211.11□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 66.5
GEMIN5Q8TEQ6 SLC39A4-204ENST00000527148 684 ntTSL 233.66■■■□□ 2.984e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 SLC39A4-207ENST00000531013 795 ntTSL 230.28■■■□□ 2.444e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.354e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.334e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 229.51■■■□□ 2.324e-15■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 SLC39A4-206ENST00000530807 498 ntTSL 225.76■■□□□ 1.714e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 PCBD1-202ENST00000493228 732 ntTSL 225.51■■□□□ 1.674e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 STK24-206ENST00000481288 656 ntTSL 325.17■■□□□ 1.624e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 SLC39A4-209ENST00000532718 668 ntTSL 1 (best)25.06■■□□□ 1.64e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.54e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 SLC39A4-205ENST00000529462 2778 ntTSL 221.87■■□□□ 1.094e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 66.4
GEMIN5Q8TEQ6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.064e-8■■■■■ 66.4
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