Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LINC00518Q8N0U6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LINC00518Q8N0U6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00518Q8N0U6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00518Q8N0U6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00518Q8N0U6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00518Q8N0U6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00518Q8N0U6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00518Q8N0U6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00518Q8N0U6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00518Q8N0U6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC00518Q8N0U6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00518Q8N0U6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00518Q8N0U6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00518Q8N0U6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00518Q8N0U6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00518Q8N0U6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00518Q8N0U6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00518Q8N0U6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00518Q8N0U6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00518Q8N0U6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00518Q8N0U6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00518Q8N0U6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00518Q8N0U6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINC00518Q8N0U6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00518Q8N0U6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00518Q8N0U6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00518Q8N0U6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00518Q8N0U6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LINC00518Q8N0U6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00518Q8N0U6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00518Q8N0U6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00518Q8N0U6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00518Q8N0U6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LINC00518Q8N0U6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LINC00518Q8N0U6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00518Q8N0U6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00518Q8N0U6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LINC00518Q8N0U6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00518Q8N0U6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00518Q8N0U6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00518Q8N0U6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00518Q8N0U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINC00518Q8N0U6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINC00518Q8N0U6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms