Protein–RNA interactions for Protein: Q3E811

RRT15, Regulator of rDNA transcription protein 15, yeastyeast

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT15Q3E811 RPP2AYOL039W 321 nt8.69□□□□□ -1.02
RRT15Q3E811 DCW1YKL046C 1350 nt8.69□□□□□ -1.02
RRT15Q3E811 UME6YDR207C 2511 nt8.67□□□□□ -1.02
RRT15Q3E811 CAC2YML102W 1407 nt8.61□□□□□ -1.03
RRT15Q3E811 EMI2YDR516C 1503 nt8.59□□□□□ -1.03
RRT15Q3E811 YLR281CYLR281C 468 nt8.56□□□□□ -1.04
RRT15Q3E811 YDL221WYDL221W 552 nt8.54□□□□□ -1.04
RRT15Q3E811 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt8.53□□□□□ -1.04
RRT15Q3E811 ART5YGR068C 1761 nt8.53□□□□□ -1.04
RRT15Q3E811 GFD2YCL036W 1701 nt8.52□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 PET9YBL030C 957 nt8.52□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 WHI5YOR083W 888 nt8.52□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 TIR4YOR009W 1464 nt8.51□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 YCH1YGR203W 447 nt8.51□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 YMR090WYMR090W 684 nt8.51□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 IRC15YPL017C 1500 nt8.49□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.48□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.48□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.48□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.48□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.48□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 YBR220CYBR220C 1683 nt8.48□□□□□ -1.05
RRT15Q3E811 SDH1YKL148C 1923 nt8.44□□□□□ -1.06
RRT15Q3E811 GIS3YLR094C 1509 nt8.4□□□□□ -1.06
RRT15Q3E811 PUS2YGL063W 1113 nt8.4□□□□□ -1.06
RRT15Q3E811 YJL152WYJL152W 360 nt8.4□□□□□ -1.06
RRT15Q3E811 YMR057CYMR057C 372 nt8.4□□□□□ -1.06
RRT15Q3E811 SCC4YER147C 1875 nt8.37□□□□□ -1.07
RRT15Q3E811 IMP2'YIL154C 1041 nt8.36□□□□□ -1.07
RRT15Q3E811 RTS2YOR077W 699 nt8.36□□□□□ -1.07
RRT15Q3E811 CUE1YMR264W 612 nt8.35□□□□□ -1.07
RRT15Q3E811 YPR011CYPR011C 981 nt8.33□□□□□ -1.08
RRT15Q3E811 DSK2YMR276W 1122 nt8.32□□□□□ -1.08
RRT15Q3E811 YLR236CYLR236C 324 nt8.3□□□□□ -1.08
RRT15Q3E811 IDH1YNL037C 1083 nt8.27□□□□□ -1.09
RRT15Q3E811 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt8.27□□□□□ -1.09
RRT15Q3E811 ERV46YAL042W 1248 nt8.21□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 GBP2YCL011C 1284 nt8.21□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 GUT2YIL155C 1950 nt8.21□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 YIL100WYIL100W 354 nt8.2□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 FMP45YDL222C 930 nt8.19□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 RRD1YIL153W 1182 nt8.19□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 DED1YOR204W 1815 nt8.18□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 SEC11YIR022W 504 nt8.17□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 YJL225CYJL225C 5277 nt8.16□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 YHL050CYHL050C 2094 nt8.16□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 YSC84YHR016C 1407 nt8.15□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 LPX1YOR084W 1164 nt8.15□□□□□ -1.1
RRT15Q3E811 TCD2YKL027W 1344 nt8.14□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 RRT12YCR045C 1476 nt8.13□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 YKR040CYKR040C 504 nt8.13□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 PCH2YBR186W 1695 nt8.12□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 YDR433WYDR433W 441 nt8.12□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 FMP52YER004W 696 nt8.11□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 RDN37-1RDN37-1 5354 nt8.1□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 RDN37-2RDN37-2 5354 nt8.1□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 FMT1YBL013W 1206 nt8.1□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 YNL195CYNL195C 786 nt8.1□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 MXR2YCL033C 507 nt8.1□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 MCH5YOR306C 1566 nt8.1□□□□□ -1.11
RRT15Q3E811 MOT3YMR070W 1473 nt8.08□□□□□ -1.12
RRT15Q3E811 SOR2YDL246C 1074 nt8.05□□□□□ -1.12
RRT15Q3E811 SOR1YJR159W 1074 nt8.05□□□□□ -1.12
RRT15Q3E811 FRD1YEL047C 1413 nt8.03□□□□□ -1.12
RRT15Q3E811 PIB2YGL023C 1908 nt8.03□□□□□ -1.12
RRT15Q3E811 PCM1YEL058W 1674 nt7.99□□□□□ -1.13
RRT15Q3E811 NCP1YHR042W 2076 nt7.99□□□□□ -1.13
RRT15Q3E811 ADH2YMR303C 1047 nt7.98□□□□□ -1.13
RRT15Q3E811 SPP1YPL138C 1062 nt7.98□□□□□ -1.13
RRT15Q3E811 BOR1YNL275W 1731 nt7.97□□□□□ -1.13
RRT15Q3E811 CWP1YKL096W 720 nt7.96□□□□□ -1.14
RRT15Q3E811 YCL042WYCL042W 360 nt7.96□□□□□ -1.14
RRT15Q3E811 RTF1YGL244W 1677 nt7.94□□□□□ -1.14
RRT15Q3E811 LCB1YMR296C 1677 nt7.93□□□□□ -1.14
RRT15Q3E811 BOP3YNL042W 1191 nt7.92□□□□□ -1.14
RRT15Q3E811 SNF6YHL025W 999 nt7.91□□□□□ -1.14
RRT15Q3E811 YIH1YCR059C 777 nt7.9□□□□□ -1.14
RRT15Q3E811 RPM1RPM1 483 nt7.88□□□□□ -1.15
RRT15Q3E811 RNQ1YCL028W 1218 nt7.87□□□□□ -1.15
RRT15Q3E811 PTK1YKL198C 1989 nt7.86□□□□□ -1.15
RRT15Q3E811 BIO4YNR057C 714 nt7.86□□□□□ -1.15
RRT15Q3E811 SIM1YIL123W 1431 nt7.86□□□□□ -1.15
RRT15Q3E811 RTG1YOL067C 534 nt7.85□□□□□ -1.15
RRT15Q3E811 YLR235CYLR235C 399 nt7.82□□□□□ -1.16
RRT15Q3E811 MRPL8YJL063C 717 nt7.81□□□□□ -1.16
RRT15Q3E811 DIC1YLR348C 897 nt7.81□□□□□ -1.16
RRT15Q3E811 LYS4YDR234W 2082 nt7.8□□□□□ -1.16
RRT15Q3E811 PTH1YHR189W 573 nt7.8□□□□□ -1.16
RRT15Q3E811 YLL053CYLL053C 459 nt7.8□□□□□ -1.16
RRT15Q3E811 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt7.76□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 YEL076CYEL076C 651 nt7.76□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 YKL030WYKL030W 606 nt7.76□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 YLR464WYLR464W 651 nt7.76□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 ALG12YNR030W 1656 nt7.76□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 FTR1YER145C 1215 nt7.75□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 ERF2YLR246W 1080 nt7.75□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 CRR1YLR213C 1269 nt7.74□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 TIM23YNR017W 669 nt7.74□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 GAL1YBR020W 1587 nt7.72□□□□□ -1.17
RRT15Q3E811 AQY1YPR192W 918 nt7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms