Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MRPL23Q16540 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MRPL23Q16540 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MRPL23Q16540 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL23Q16540 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MRPL23Q16540 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MRPL23Q16540 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MRPL23Q16540 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MRPL23Q16540 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MRPL23Q16540 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPL23Q16540 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL23Q16540 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPL23Q16540 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MRPL23Q16540 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL23Q16540 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL23Q16540 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MRPL23Q16540 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MRPL23Q16540 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL23Q16540 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MRPL23Q16540 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MRPL23Q16540 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
MRPL23Q16540 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MRPL23Q16540 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MRPL23Q16540 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MRPL23Q16540 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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