Protein–RNA interactions for Protein: Q12499

NOP58, Nucleolar protein 58, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP58Q12499 BOP3YNL042W 1191 nt13.39□□□□□ -0.27
NOP58Q12499 PTK1YKL198C 1989 nt13.36□□□□□ -0.27
NOP58Q12499 RRT12YCR045C 1476 nt13.35□□□□□ -0.27
NOP58Q12499 GFD2YCL036W 1701 nt13.34□□□□□ -0.27
NOP58Q12499 FPS1YLL043W 2010 nt13.34□□□□□ -0.27
NOP58Q12499 CCT6YDR188W 1641 nt13.31□□□□□ -0.28
NOP58Q12499 ART5YGR068C 1761 nt13.3□□□□□ -0.28
NOP58Q12499 RTS2YOR077W 699 nt13.3□□□□□ -0.28
NOP58Q12499 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.28□□□□□ -0.28
NOP58Q12499 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.28□□□□□ -0.28
NOP58Q12499 BOR1YNL275W 1731 nt13.25□□□□□ -0.29
NOP58Q12499 YNL195CYNL195C 786 nt13.21□□□□□ -0.29
NOP58Q12499 CUE1YMR264W 612 nt13.19□□□□□ -0.3
NOP58Q12499 UME6YDR207C 2511 nt13.19□□□□□ -0.3
NOP58Q12499 PET9YBL030C 957 nt13.17□□□□□ -0.3
NOP58Q12499 LSM3YLR438C-A 270 nt13.15□□□□□ -0.3
NOP58Q12499 YJL225CYJL225C 5277 nt13.07□□□□□ -0.32
NOP58Q12499 NCP1YHR042W 2076 nt13.06□□□□□ -0.32
NOP58Q12499 YFL054CYFL054C 1941 nt13.06□□□□□ -0.32
NOP58Q12499 YIL100WYIL100W 354 nt13.04□□□□□ -0.32
NOP58Q12499 YCH1YGR203W 447 nt13.01□□□□□ -0.33
NOP58Q12499 SPT8YLR055C 1809 nt13□□□□□ -0.33
NOP58Q12499 WWM1YFL010C 636 nt13□□□□□ -0.33
NOP58Q12499 TIR4YOR009W 1464 nt12.9□□□□□ -0.34
NOP58Q12499 YMR057CYMR057C 372 nt12.89□□□□□ -0.35
NOP58Q12499 YLR236CYLR236C 324 nt12.85□□□□□ -0.35
NOP58Q12499 MCH5YOR306C 1566 nt12.81□□□□□ -0.36
NOP58Q12499 HSP60YLR259C 1719 nt12.8□□□□□ -0.36
NOP58Q12499 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.8□□□□□ -0.36
NOP58Q12499 ALG12YNR030W 1656 nt12.76□□□□□ -0.37
NOP58Q12499 PST2YDR032C 597 nt12.73□□□□□ -0.37
NOP58Q12499 LCB1YMR296C 1677 nt12.71□□□□□ -0.37
NOP58Q12499 Q0182Q0182 405 nt12.71□□□□□ -0.37
NOP58Q12499 SWE1YJL187C 2460 nt12.71□□□□□ -0.37
NOP58Q12499 YGR021WYGR021W 873 nt12.62□□□□□ -0.39
NOP58Q12499 GLK1YCL040W 1503 nt12.61□□□□□ -0.39
NOP58Q12499 HOM6YJR139C 1080 nt12.53□□□□□ -0.4
NOP58Q12499 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.49□□□□□ -0.41
NOP58Q12499 LYS4YDR234W 2082 nt12.47□□□□□ -0.41
NOP58Q12499 NPL3YDR432W 1245 nt12.42□□□□□ -0.42
NOP58Q12499 YJL152WYJL152W 360 nt12.4□□□□□ -0.42
NOP58Q12499 FUR4YBR021W 1902 nt12.4□□□□□ -0.42
NOP58Q12499 DSK2YMR276W 1122 nt12.39□□□□□ -0.43
NOP58Q12499 NAR1YNL240C 1476 nt12.39□□□□□ -0.43
NOP58Q12499 SIM1YIL123W 1431 nt12.37□□□□□ -0.43
NOP58Q12499 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.36□□□□□ -0.43
NOP58Q12499 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.36□□□□□ -0.43
NOP58Q12499 RKM5YLR137W 1104 nt12.35□□□□□ -0.43
NOP58Q12499 BIO4YNR057C 714 nt12.35□□□□□ -0.43
NOP58Q12499 MNP1YGL068W 585 nt12.32□□□□□ -0.44
NOP58Q12499 AAC1YMR056C 930 nt12.32□□□□□ -0.44
NOP58Q12499 PRP4YPR178W 1398 nt12.31□□□□□ -0.44
NOP58Q12499 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.29□□□□□ -0.44
NOP58Q12499 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.27□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 YEL076CYEL076C 651 nt12.27□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 YLR464WYLR464W 651 nt12.27□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 SHU1YHL006C 453 nt12.26□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.26□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 DPS1YLL018C 1674 nt12.25□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 PCM1YEL058W 1674 nt12.23□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 YKL097CYKL097C 411 nt12.22□□□□□ -0.45
NOP58Q12499 FMP52YER004W 696 nt12.18□□□□□ -0.46
NOP58Q12499 RRD1YIL153W 1182 nt12.17□□□□□ -0.46
NOP58Q12499 BIO5YNR056C 1686 nt12.16□□□□□ -0.46
NOP58Q12499 CCA1YER168C 1641 nt12.13□□□□□ -0.47
NOP58Q12499 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.12□□□□□ -0.47
NOP58Q12499 BMT6YLR063W 1098 nt12.12□□□□□ -0.47
NOP58Q12499 PBP1YGR178C 2169 nt12.11□□□□□ -0.47
NOP58Q12499 CYT2YKL087C 675 nt12.09□□□□□ -0.47
NOP58Q12499 ERF2YLR246W 1080 nt12.08□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 SNF1YDR477W 1902 nt12.07□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 MOT3YMR070W 1473 nt12.06□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 CRR1YLR213C 1269 nt12.05□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 YKR005CYKR005C 1578 nt12.04□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 CMP2YML057W 1815 nt12.03□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 SNF6YHL025W 999 nt12.03□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 RAX1YOR301W 1308 nt12.03□□□□□ -0.48
NOP58Q12499 DED1YOR204W 1815 nt12□□□□□ -0.49
NOP58Q12499 ADH2YMR303C 1047 nt11.99□□□□□ -0.49
NOP58Q12499 FMT1YBL013W 1206 nt11.97□□□□□ -0.49
NOP58Q12499 HEM12YDR047W 1089 nt11.96□□□□□ -0.49
NOP58Q12499 CWP1YKL096W 720 nt11.96□□□□□ -0.49
NOP58Q12499 MIC10YCL057C-A 294 nt11.95□□□□□ -0.5
NOP58Q12499 WSC2YNL283C 1512 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP58Q12499 TCD2YKL027W 1344 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP58Q12499 GBP2YCL011C 1284 nt11.91□□□□□ -0.5
NOP58Q12499 IRC24YIR036C 792 nt11.9□□□□□ -0.5
NOP58Q12499 RPM1RPM1 483 nt11.9□□□□□ -0.5
NOP58Q12499 YGR259CYGR259C 441 nt11.88□□□□□ -0.51
NOP58Q12499 HSL7YBR133C 2484 nt11.87□□□□□ -0.51
NOP58Q12499 SNG1YGR197C 1644 nt11.86□□□□□ -0.51
NOP58Q12499 IDH1YNL037C 1083 nt11.85□□□□□ -0.51
NOP58Q12499 ATF2YGR177C 1608 nt11.85□□□□□ -0.51
NOP58Q12499 YLL053CYLL053C 459 nt11.83□□□□□ -0.52
NOP58Q12499 YIH1YCR059C 777 nt11.82□□□□□ -0.52
NOP58Q12499 YCL074WYCL074W 927 nt11.8□□□□□ -0.52
NOP58Q12499 YFL067WYFL067W 528 nt11.78□□□□□ -0.52
NOP58Q12499 DUS1YML080W 1272 nt11.78□□□□□ -0.52
NOP58Q12499 YAT1YAR035W 2064 nt11.77□□□□□ -0.53
NOP58Q12499 YOL037CYOL037C 354 nt11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 346.2 ms