Protein–RNA interactions for Protein: Q12481

RRP36, rRNA biogenesis protein RRP36, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP36Q12481 SCC4YER147C 1875 nt12.25□□□□□ -0.45
RRP36Q12481 IRC15YPL017C 1500 nt12.21□□□□□ -0.46
RRP36Q12481 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.19□□□□□ -0.46
RRP36Q12481 HOM6YJR139C 1080 nt12.18□□□□□ -0.46
RRP36Q12481 ART5YGR068C 1761 nt12.18□□□□□ -0.46
RRP36Q12481 GIS3YLR094C 1509 nt12.16□□□□□ -0.46
RRP36Q12481 GFD2YCL036W 1701 nt12.14□□□□□ -0.47
RRP36Q12481 SEC11YIR022W 504 nt12.14□□□□□ -0.47
RRP36Q12481 PET9YBL030C 957 nt12.12□□□□□ -0.47
RRP36Q12481 NVJ2YPR091C 2313 nt12.1□□□□□ -0.47
RRP36Q12481 PCH2YBR186W 1695 nt12.09□□□□□ -0.47
RRP36Q12481 YCH1YGR203W 447 nt12.07□□□□□ -0.48
RRP36Q12481 RTS2YOR077W 699 nt12.06□□□□□ -0.48
RRP36Q12481 MNP1YGL068W 585 nt12.03□□□□□ -0.48
RRP36Q12481 GUT2YIL155C 1950 nt12.02□□□□□ -0.49
RRP36Q12481 RKM5YLR137W 1104 nt12.01□□□□□ -0.49
RRP36Q12481 YSC84YHR016C 1407 nt11.98□□□□□ -0.49
RRP36Q12481 CUE1YMR264W 612 nt11.97□□□□□ -0.49
RRP36Q12481 TIR4YOR009W 1464 nt11.95□□□□□ -0.5
RRP36Q12481 YMR057CYMR057C 372 nt11.93□□□□□ -0.5
RRP36Q12481 YNL195CYNL195C 786 nt11.92□□□□□ -0.5
RRP36Q12481 NPL3YDR432W 1245 nt11.9□□□□□ -0.5
RRP36Q12481 YOL037CYOL037C 354 nt11.9□□□□□ -0.5
RRP36Q12481 PAC11YDR488C 1602 nt11.89□□□□□ -0.51
RRP36Q12481 YIL100WYIL100W 354 nt11.89□□□□□ -0.51
RRP36Q12481 YHL050CYHL050C 2094 nt11.88□□□□□ -0.51
RRP36Q12481 YOR139CYOR139C 393 nt11.88□□□□□ -0.51
RRP36Q12481 RRT12YCR045C 1476 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP36Q12481 YJL152WYJL152W 360 nt11.82□□□□□ -0.52
RRP36Q12481 YLR236CYLR236C 324 nt11.82□□□□□ -0.52
RRP36Q12481 RTF1YGL244W 1677 nt11.78□□□□□ -0.52
RRP36Q12481 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.78□□□□□ -0.52
RRP36Q12481 PIB2YGL023C 1908 nt11.77□□□□□ -0.53
RRP36Q12481 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.75□□□□□ -0.53
RRP36Q12481 BOP3YNL042W 1191 nt11.74□□□□□ -0.53
RRP36Q12481 MOT3YMR070W 1473 nt11.64□□□□□ -0.55
RRP36Q12481 PTK1YKL198C 1989 nt11.58□□□□□ -0.56
RRP36Q12481 YLR281CYLR281C 468 nt11.56□□□□□ -0.56
RRP36Q12481 YJL225CYJL225C 5277 nt11.55□□□□□ -0.56
RRP36Q12481 WHI5YOR083W 888 nt11.53□□□□□ -0.56
RRP36Q12481 NCP1YHR042W 2076 nt11.52□□□□□ -0.57
RRP36Q12481 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.46□□□□□ -0.57
RRP36Q12481 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.46□□□□□ -0.57
RRP36Q12481 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.46□□□□□ -0.57
RRP36Q12481 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.46□□□□□ -0.57
RRP36Q12481 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.46□□□□□ -0.57
RRP36Q12481 IDH1YNL037C 1083 nt11.46□□□□□ -0.57
RRP36Q12481 PUS2YGL063W 1113 nt11.43□□□□□ -0.58
RRP36Q12481 GBP2YCL011C 1284 nt11.42□□□□□ -0.58
RRP36Q12481 YFL054CYFL054C 1941 nt11.41□□□□□ -0.58
RRP36Q12481 IMP2'YIL154C 1041 nt11.41□□□□□ -0.58
RRP36Q12481 LCB1YMR296C 1677 nt11.4□□□□□ -0.59
RRP36Q12481 RRD1YIL153W 1182 nt11.39□□□□□ -0.59
RRP36Q12481 FMP52YER004W 696 nt11.38□□□□□ -0.59
RRP36Q12481 TCD2YKL027W 1344 nt11.36□□□□□ -0.59
RRP36Q12481 SIM1YIL123W 1431 nt11.32□□□□□ -0.6
RRP36Q12481 DSK2YMR276W 1122 nt11.31□□□□□ -0.6
RRP36Q12481 PCM1YEL058W 1674 nt11.3□□□□□ -0.6
RRP36Q12481 SPT8YLR055C 1809 nt11.29□□□□□ -0.6
RRP36Q12481 DED1YOR204W 1815 nt11.29□□□□□ -0.6
RRP36Q12481 YDR433WYDR433W 441 nt11.21□□□□□ -0.61
RRP36Q12481 SNF6YHL025W 999 nt11.21□□□□□ -0.61
RRP36Q12481 CWP1YKL096W 720 nt11.21□□□□□ -0.61
RRP36Q12481 FMT1YBL013W 1206 nt11.21□□□□□ -0.61
RRP36Q12481 ADH2YMR303C 1047 nt11.19□□□□□ -0.62
RRP36Q12481 LYS4YDR234W 2082 nt11.16□□□□□ -0.62
RRP36Q12481 BIO4YNR057C 714 nt11.15□□□□□ -0.62
RRP36Q12481 YCL042WYCL042W 360 nt11.15□□□□□ -0.62
RRP36Q12481 BOR1YNL275W 1731 nt11.12□□□□□ -0.63
RRP36Q12481 FMP45YDL222C 930 nt11.12□□□□□ -0.63
RRP36Q12481 YPR011CYPR011C 981 nt11.11□□□□□ -0.63
RRP36Q12481 MXR2YCL033C 507 nt11.11□□□□□ -0.63
RRP36Q12481 SWE1YJL187C 2460 nt11.08□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 SOR2YDL246C 1074 nt11.08□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 SOR1YJR159W 1074 nt11.08□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 RPM1RPM1 483 nt11.08□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 UME6YDR207C 2511 nt11.08□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 ERF2YLR246W 1080 nt11.07□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 ERV46YAL042W 1248 nt11.06□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.04□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 YKR040CYKR040C 504 nt11.03□□□□□ -0.64
RRP36Q12481 YIH1YCR059C 777 nt11.02□□□□□ -0.65
RRP36Q12481 YLL053CYLL053C 459 nt10.99□□□□□ -0.65
RRP36Q12481 LPX1YOR084W 1164 nt10.99□□□□□ -0.65
RRP36Q12481 RNQ1YCL028W 1218 nt10.99□□□□□ -0.65
RRP36Q12481 CRR1YLR213C 1269 nt10.98□□□□□ -0.65
RRP36Q12481 FRD1YEL047C 1413 nt10.96□□□□□ -0.65
RRP36Q12481 HEM12YDR047W 1089 nt10.94□□□□□ -0.66
RRP36Q12481 YFL067WYFL067W 528 nt10.92□□□□□ -0.66
RRP36Q12481 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.91□□□□□ -0.66
RRP36Q12481 ATF2YGR177C 1608 nt10.9□□□□□ -0.66
RRP36Q12481 HSP60YLR259C 1719 nt10.89□□□□□ -0.67
RRP36Q12481 RAX1YOR301W 1308 nt10.88□□□□□ -0.67
RRP36Q12481 FTR1YER145C 1215 nt10.88□□□□□ -0.67
RRP36Q12481 DDR2YOL052C-A 186 nt10.87□□□□□ -0.67
RRP36Q12481 MIC10YCL057C-A 294 nt10.87□□□□□ -0.67
RRP36Q12481 SNG1YGR197C 1644 nt10.85□□□□□ -0.67
RRP36Q12481 DIC1YLR348C 897 nt10.85□□□□□ -0.67
RRP36Q12481 GLK1YCL040W 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
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