Protein–RNA interactions for Protein: Q12473

FRE6, Ferric reductase transmembrane component 6, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FRE6Q12473 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.12□□□□□ -0.63
FRE6Q12473 HOM6YJR139C 1080 nt11.09□□□□□ -0.63
FRE6Q12473 IRC15YPL017C 1500 nt11.08□□□□□ -0.64
FRE6Q12473 SCC4YER147C 1875 nt11.06□□□□□ -0.64
FRE6Q12473 ART5YGR068C 1761 nt11.04□□□□□ -0.64
FRE6Q12473 GIS3YLR094C 1509 nt11.03□□□□□ -0.64
FRE6Q12473 GFD2YCL036W 1701 nt11.02□□□□□ -0.65
FRE6Q12473 MNP1YGL068W 585 nt11.01□□□□□ -0.65
FRE6Q12473 RTS2YOR077W 699 nt10.99□□□□□ -0.65
FRE6Q12473 PET9YBL030C 957 nt10.95□□□□□ -0.66
FRE6Q12473 RKM5YLR137W 1104 nt10.94□□□□□ -0.66
FRE6Q12473 PAC11YDR488C 1602 nt10.93□□□□□ -0.66
FRE6Q12473 SEC11YIR022W 504 nt10.91□□□□□ -0.66
FRE6Q12473 PCH2YBR186W 1695 nt10.89□□□□□ -0.67
FRE6Q12473 TIR4YOR009W 1464 nt10.89□□□□□ -0.67
FRE6Q12473 YCH1YGR203W 447 nt10.88□□□□□ -0.67
FRE6Q12473 YKL097CYKL097C 411 nt10.88□□□□□ -0.67
FRE6Q12473 YSC84YHR016C 1407 nt10.85□□□□□ -0.67
FRE6Q12473 CUE1YMR264W 612 nt10.84□□□□□ -0.67
FRE6Q12473 GUT2YIL155C 1950 nt10.84□□□□□ -0.67
FRE6Q12473 YMR057CYMR057C 372 nt10.82□□□□□ -0.68
FRE6Q12473 YHL050CYHL050C 2094 nt10.75□□□□□ -0.69
FRE6Q12473 YIL100WYIL100W 354 nt10.75□□□□□ -0.69
FRE6Q12473 YJL152WYJL152W 360 nt10.74□□□□□ -0.69
FRE6Q12473 YNL195CYNL195C 786 nt10.73□□□□□ -0.69
FRE6Q12473 RRT12YCR045C 1476 nt10.73□□□□□ -0.69
FRE6Q12473 NPL3YDR432W 1245 nt10.72□□□□□ -0.69
FRE6Q12473 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.68□□□□□ -0.7
FRE6Q12473 YLR236CYLR236C 324 nt10.67□□□□□ -0.7
FRE6Q12473 YOL037CYOL037C 354 nt10.67□□□□□ -0.7
FRE6Q12473 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.64□□□□□ -0.71
FRE6Q12473 NVJ2YPR091C 2313 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE6Q12473 PIB2YGL023C 1908 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE6Q12473 RTF1YGL244W 1677 nt10.63□□□□□ -0.71
FRE6Q12473 BOP3YNL042W 1191 nt10.57□□□□□ -0.72
FRE6Q12473 YOR139CYOR139C 393 nt10.49□□□□□ -0.73
FRE6Q12473 RPM1RPM1 483 nt10.48□□□□□ -0.73
FRE6Q12473 WHI5YOR083W 888 nt10.47□□□□□ -0.73
FRE6Q12473 PTK1YKL198C 1989 nt10.45□□□□□ -0.74
FRE6Q12473 YLR281CYLR281C 468 nt10.43□□□□□ -0.74
FRE6Q12473 IDH1YNL037C 1083 nt10.4□□□□□ -0.74
FRE6Q12473 NCP1YHR042W 2076 nt10.4□□□□□ -0.75
FRE6Q12473 GBP2YCL011C 1284 nt10.37□□□□□ -0.75
FRE6Q12473 RRD1YIL153W 1182 nt10.36□□□□□ -0.75
FRE6Q12473 LCB1YMR296C 1677 nt10.34□□□□□ -0.75
FRE6Q12473 TCD2YKL027W 1344 nt10.31□□□□□ -0.76
FRE6Q12473 YFL054CYFL054C 1941 nt10.29□□□□□ -0.76
FRE6Q12473 FMP52YER004W 696 nt10.29□□□□□ -0.76
FRE6Q12473 DED1YOR204W 1815 nt10.27□□□□□ -0.77
FRE6Q12473 PCM1YEL058W 1674 nt10.25□□□□□ -0.77
FRE6Q12473 SIM1YIL123W 1431 nt10.24□□□□□ -0.77
FRE6Q12473 PUS2YGL063W 1113 nt10.24□□□□□ -0.77
FRE6Q12473 IMP2'YIL154C 1041 nt10.23□□□□□ -0.77
FRE6Q12473 FMT1YBL013W 1206 nt10.21□□□□□ -0.77
FRE6Q12473 DSK2YMR276W 1122 nt10.21□□□□□ -0.77
FRE6Q12473 YDR433WYDR433W 441 nt10.2□□□□□ -0.78
FRE6Q12473 CWP1YKL096W 720 nt10.19□□□□□ -0.78
FRE6Q12473 SPT8YLR055C 1809 nt10.19□□□□□ -0.78
FRE6Q12473 FRE6YLL051C 2139 nt10.18□□□□□ -0.78
FRE6Q12473 ADH2YMR303C 1047 nt10.17□□□□□ -0.78
FRE6Q12473 SNF6YHL025W 999 nt10.16□□□□□ -0.78
FRE6Q12473 MXR2YCL033C 507 nt10.15□□□□□ -0.78
FRE6Q12473 BIO4YNR057C 714 nt10.13□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 FMP45YDL222C 930 nt10.11□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 YPR011CYPR011C 981 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 LYS4YDR234W 2082 nt10.1□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 YCL042WYCL042W 360 nt10.09□□□□□ -0.79
FRE6Q12473 SOR2YDL246C 1074 nt10.07□□□□□ -0.8
FRE6Q12473 SOR1YJR159W 1074 nt10.07□□□□□ -0.8
FRE6Q12473 LPX1YOR084W 1164 nt10.05□□□□□ -0.8
FRE6Q12473 ERV46YAL042W 1248 nt10.03□□□□□ -0.8
FRE6Q12473 SWE1YJL187C 2460 nt10.02□□□□□ -0.8
FRE6Q12473 YJL225CYJL225C 5277 nt10.02□□□□□ -0.8
FRE6Q12473 YKR040CYKR040C 504 nt10.01□□□□□ -0.81
FRE6Q12473 ERF2YLR246W 1080 nt10.01□□□□□ -0.81
FRE6Q12473 BOR1YNL275W 1731 nt9.99□□□□□ -0.81
FRE6Q12473 YIH1YCR059C 777 nt9.99□□□□□ -0.81
FRE6Q12473 CRR1YLR213C 1269 nt9.98□□□□□ -0.81
FRE6Q12473 FRD1YEL047C 1413 nt9.98□□□□□ -0.81
FRE6Q12473 YLL053CYLL053C 459 nt9.97□□□□□ -0.81
FRE6Q12473 RNQ1YCL028W 1218 nt9.95□□□□□ -0.82
FRE6Q12473 HEM12YDR047W 1089 nt9.91□□□□□ -0.82
FRE6Q12473 UME6YDR207C 2511 nt9.9□□□□□ -0.82
FRE6Q12473 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.9□□□□□ -0.82
FRE6Q12473 ATF2YGR177C 1608 nt9.89□□□□□ -0.83
FRE6Q12473 MIC10YCL057C-A 294 nt9.88□□□□□ -0.83
FRE6Q12473 DIC1YLR348C 897 nt9.87□□□□□ -0.83
FRE6Q12473 FTR1YER145C 1215 nt9.86□□□□□ -0.83
FRE6Q12473 YFL067WYFL067W 528 nt9.86□□□□□ -0.83
FRE6Q12473 SNG1YGR197C 1644 nt9.84□□□□□ -0.83
FRE6Q12473 RAX1YOR301W 1308 nt9.83□□□□□ -0.84
FRE6Q12473 TRM5YHR070W 1500 nt9.83□□□□□ -0.84
FRE6Q12473 HSP60YLR259C 1719 nt9.83□□□□□ -0.84
FRE6Q12473 GAL1YBR020W 1587 nt9.83□□□□□ -0.84
FRE6Q12473 DDR2YOL052C-A 186 nt9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.8 ms