Protein–RNA interactions for Protein: Q12471

PFK27, 6-phosphofructo-2-kinase 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFK27Q12471 HOM6YJR139C 1080 nt11.79□□□□□ -0.52
PFK27Q12471 SCC4YER147C 1875 nt11.78□□□□□ -0.52
PFK27Q12471 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.77□□□□□ -0.53
PFK27Q12471 ART5YGR068C 1761 nt11.74□□□□□ -0.53
PFK27Q12471 GFD2YCL036W 1701 nt11.74□□□□□ -0.53
PFK27Q12471 GIS3YLR094C 1509 nt11.72□□□□□ -0.53
PFK27Q12471 MNP1YGL068W 585 nt11.68□□□□□ -0.54
PFK27Q12471 RTS2YOR077W 699 nt11.65□□□□□ -0.54
PFK27Q12471 PET9YBL030C 957 nt11.64□□□□□ -0.55
PFK27Q12471 PCH2YBR186W 1695 nt11.64□□□□□ -0.55
PFK27Q12471 SEC11YIR022W 504 nt11.63□□□□□ -0.55
PFK27Q12471 RKM5YLR137W 1104 nt11.62□□□□□ -0.55
PFK27Q12471 GUT2YIL155C 1950 nt11.58□□□□□ -0.56
PFK27Q12471 TIR4YOR009W 1464 nt11.57□□□□□ -0.56
PFK27Q12471 YCH1YGR203W 447 nt11.57□□□□□ -0.56
PFK27Q12471 YSC84YHR016C 1407 nt11.55□□□□□ -0.56
PFK27Q12471 CUE1YMR264W 612 nt11.53□□□□□ -0.56
PFK27Q12471 YMR057CYMR057C 372 nt11.49□□□□□ -0.57
PFK27Q12471 YHL050CYHL050C 2094 nt11.48□□□□□ -0.57
PFK27Q12471 RRT12YCR045C 1476 nt11.43□□□□□ -0.58
PFK27Q12471 PAC11YDR488C 1602 nt11.42□□□□□ -0.58
PFK27Q12471 NPL3YDR432W 1245 nt11.42□□□□□ -0.58
PFK27Q12471 YIL100WYIL100W 354 nt11.41□□□□□ -0.58
PFK27Q12471 PIB2YGL023C 1908 nt11.41□□□□□ -0.58
PFK27Q12471 FPS1YLL043W 2010 nt11.4□□□□□ -0.58
PFK27Q12471 YNL195CYNL195C 786 nt11.39□□□□□ -0.59
PFK27Q12471 YJL152WYJL152W 360 nt11.36□□□□□ -0.59
PFK27Q12471 YOR139CYOR139C 393 nt11.36□□□□□ -0.59
PFK27Q12471 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.35□□□□□ -0.59
PFK27Q12471 RTF1YGL244W 1677 nt11.34□□□□□ -0.59
PFK27Q12471 YLR236CYLR236C 324 nt11.34□□□□□ -0.59
PFK27Q12471 YOL037CYOL037C 354 nt11.32□□□□□ -0.6
PFK27Q12471 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.27□□□□□ -0.61
PFK27Q12471 BOP3YNL042W 1191 nt11.26□□□□□ -0.61
PFK27Q12471 MOT3YMR070W 1473 nt11.24□□□□□ -0.61
PFK27Q12471 PTK1YKL198C 1989 nt11.17□□□□□ -0.62
PFK27Q12471 NCP1YHR042W 2076 nt11.14□□□□□ -0.63
PFK27Q12471 WHI5YOR083W 888 nt11.11□□□□□ -0.63
PFK27Q12471 YLR281CYLR281C 468 nt11.08□□□□□ -0.64
PFK27Q12471 LCB1YMR296C 1677 nt11.03□□□□□ -0.64
PFK27Q12471 RRD1YIL153W 1182 nt11.02□□□□□ -0.65
PFK27Q12471 IDH1YNL037C 1083 nt11.02□□□□□ -0.65
PFK27Q12471 GBP2YCL011C 1284 nt11□□□□□ -0.65
PFK27Q12471 YFL054CYFL054C 1941 nt10.96□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 FMP52YER004W 696 nt10.95□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 DED1YOR204W 1815 nt10.94□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.94□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.94□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.94□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.94□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.94□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 NVJ2YPR091C 2313 nt10.92□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 TCD2YKL027W 1344 nt10.92□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 PCM1YEL058W 1674 nt10.9□□□□□ -0.66
PFK27Q12471 SPT8YLR055C 1809 nt10.88□□□□□ -0.67
PFK27Q12471 SIM1YIL123W 1431 nt10.87□□□□□ -0.67
PFK27Q12471 IMP2'YIL154C 1041 nt10.87□□□□□ -0.67
PFK27Q12471 FMT1YBL013W 1206 nt10.86□□□□□ -0.67
PFK27Q12471 DSK2YMR276W 1122 nt10.85□□□□□ -0.67
PFK27Q12471 PUS2YGL063W 1113 nt10.84□□□□□ -0.67
PFK27Q12471 CWP1YKL096W 720 nt10.81□□□□□ -0.68
PFK27Q12471 ADH2YMR303C 1047 nt10.81□□□□□ -0.68
PFK27Q12471 LYS4YDR234W 2082 nt10.8□□□□□ -0.68
PFK27Q12471 YDR433WYDR433W 441 nt10.8□□□□□ -0.68
PFK27Q12471 SNF6YHL025W 999 nt10.79□□□□□ -0.68
PFK27Q12471 BIO4YNR057C 714 nt10.78□□□□□ -0.68
PFK27Q12471 MXR2YCL033C 507 nt10.76□□□□□ -0.69
PFK27Q12471 FMP45YDL222C 930 nt10.75□□□□□ -0.69
PFK27Q12471 YPR011CYPR011C 981 nt10.75□□□□□ -0.69
PFK27Q12471 SOR2YDL246C 1074 nt10.73□□□□□ -0.69
PFK27Q12471 SOR1YJR159W 1074 nt10.73□□□□□ -0.69
PFK27Q12471 YJL225CYJL225C 5277 nt10.71□□□□□ -0.69
PFK27Q12471 YCL042WYCL042W 360 nt10.7□□□□□ -0.7
PFK27Q12471 SWE1YJL187C 2460 nt10.69□□□□□ -0.7
PFK27Q12471 ERV46YAL042W 1248 nt10.67□□□□□ -0.7
PFK27Q12471 ERF2YLR246W 1080 nt10.65□□□□□ -0.7
PFK27Q12471 LPX1YOR084W 1164 nt10.65□□□□□ -0.7
PFK27Q12471 BOR1YNL275W 1731 nt10.64□□□□□ -0.71
PFK27Q12471 YIH1YCR059C 777 nt10.64□□□□□ -0.71
PFK27Q12471 YKR040CYKR040C 504 nt10.63□□□□□ -0.71
PFK27Q12471 FRD1YEL047C 1413 nt10.62□□□□□ -0.71
PFK27Q12471 CRR1YLR213C 1269 nt10.62□□□□□ -0.71
PFK27Q12471 YLL053CYLL053C 459 nt10.6□□□□□ -0.71
PFK27Q12471 RNQ1YCL028W 1218 nt10.59□□□□□ -0.71
PFK27Q12471 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.53□□□□□ -0.72
PFK27Q12471 ATF2YGR177C 1608 nt10.53□□□□□ -0.72
PFK27Q12471 HEM12YDR047W 1089 nt10.52□□□□□ -0.73
PFK27Q12471 MIC10YCL057C-A 294 nt10.51□□□□□ -0.73
PFK27Q12471 FTR1YER145C 1215 nt10.49□□□□□ -0.73
PFK27Q12471 HSP60YLR259C 1719 nt10.49□□□□□ -0.73
PFK27Q12471 YFL067WYFL067W 528 nt10.48□□□□□ -0.73
PFK27Q12471 DIC1YLR348C 897 nt10.48□□□□□ -0.73
PFK27Q12471 SNG1YGR197C 1644 nt10.47□□□□□ -0.73
PFK27Q12471 GAL1YBR020W 1587 nt10.46□□□□□ -0.74
PFK27Q12471 TRM5YHR070W 1500 nt10.45□□□□□ -0.74
PFK27Q12471 RAX1YOR301W 1308 nt10.44□□□□□ -0.74
PFK27Q12471 RPM1RPM1 483 nt10.44□□□□□ -0.74
PFK27Q12471 DDR2YOL052C-A 186 nt10.42□□□□□ -0.74
PFK27Q12471 CCA1YER168C 1641 nt10.41□□□□□ -0.74
PFK27Q12471 GLK1YCL040W 1503 nt10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8 ms