Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 RPP2AYOL039W 321 nt11.02□□□□□ -0.65
HMS1Q12398 PTP1YDL230W 1008 nt11.01□□□□□ -0.65
HMS1Q12398 YJL225CYJL225C 5277 nt10.93□□□□□ -0.66
HMS1Q12398 CAC2YML102W 1407 nt10.92□□□□□ -0.66
HMS1Q12398 EMI2YDR516C 1503 nt10.89□□□□□ -0.67
HMS1Q12398 ART5YGR068C 1761 nt10.85□□□□□ -0.67
HMS1Q12398 UME6YDR207C 2511 nt10.85□□□□□ -0.67
HMS1Q12398 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.85□□□□□ -0.67
HMS1Q12398 YLR281CYLR281C 468 nt10.85□□□□□ -0.67
HMS1Q12398 TIR4YOR009W 1464 nt10.84□□□□□ -0.67
HMS1Q12398 GFD2YCL036W 1701 nt10.84□□□□□ -0.67
HMS1Q12398 YDL221WYDL221W 552 nt10.83□□□□□ -0.68
HMS1Q12398 WHI5YOR083W 888 nt10.82□□□□□ -0.68
HMS1Q12398 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.8□□□□□ -0.68
HMS1Q12398 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.8□□□□□ -0.68
HMS1Q12398 PET9YBL030C 957 nt10.79□□□□□ -0.68
HMS1Q12398 YMR090WYMR090W 684 nt10.79□□□□□ -0.68
HMS1Q12398 IRC15YPL017C 1500 nt10.77□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.76□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.76□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.76□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.76□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.76□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 YCH1YGR203W 447 nt10.76□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 YBR220CYBR220C 1683 nt10.73□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 YJL152WYJL152W 360 nt10.72□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 SDH1YKL148C 1923 nt10.71□□□□□ -0.69
HMS1Q12398 PUS2YGL063W 1113 nt10.69□□□□□ -0.7
HMS1Q12398 YMR057CYMR057C 372 nt10.69□□□□□ -0.7
HMS1Q12398 RTS2YOR077W 699 nt10.69□□□□□ -0.7
HMS1Q12398 GIS3YLR094C 1509 nt10.67□□□□□ -0.7
HMS1Q12398 SCC4YER147C 1875 nt10.63□□□□□ -0.71
HMS1Q12398 CUE1YMR264W 612 nt10.6□□□□□ -0.71
HMS1Q12398 DSK2YMR276W 1122 nt10.6□□□□□ -0.71
HMS1Q12398 YLR236CYLR236C 324 nt10.59□□□□□ -0.71
HMS1Q12398 IMP2'YIL154C 1041 nt10.58□□□□□ -0.72
HMS1Q12398 YPR011CYPR011C 981 nt10.56□□□□□ -0.72
HMS1Q12398 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.56□□□□□ -0.72
HMS1Q12398 IDH1YNL037C 1083 nt10.55□□□□□ -0.72
HMS1Q12398 GBP2YCL011C 1284 nt10.47□□□□□ -0.73
HMS1Q12398 FMP45YDL222C 930 nt10.44□□□□□ -0.74
HMS1Q12398 YIL100WYIL100W 354 nt10.44□□□□□ -0.74
HMS1Q12398 ERV46YAL042W 1248 nt10.41□□□□□ -0.74
HMS1Q12398 RRD1YIL153W 1182 nt10.4□□□□□ -0.74
HMS1Q12398 YDR433WYDR433W 441 nt10.39□□□□□ -0.75
HMS1Q12398 LPX1YOR084W 1164 nt10.39□□□□□ -0.75
HMS1Q12398 DED1YOR204W 1815 nt10.38□□□□□ -0.75
HMS1Q12398 YSC84YHR016C 1407 nt10.37□□□□□ -0.75
HMS1Q12398 TCD2YKL027W 1344 nt10.36□□□□□ -0.75
HMS1Q12398 MXR2YCL033C 507 nt10.35□□□□□ -0.75
HMS1Q12398 YHL050CYHL050C 2094 nt10.35□□□□□ -0.75
HMS1Q12398 SEC11YIR022W 504 nt10.33□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 RRT12YCR045C 1476 nt10.32□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 GUT2YIL155C 1950 nt10.32□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 YKR040CYKR040C 504 nt10.3□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 YNL195CYNL195C 786 nt10.3□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 MOT3YMR070W 1473 nt10.3□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 PCH2YBR186W 1695 nt10.28□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 FMT1YBL013W 1206 nt10.28□□□□□ -0.76
HMS1Q12398 BOR1YNL275W 1731 nt10.27□□□□□ -0.77
HMS1Q12398 FMP52YER004W 696 nt10.26□□□□□ -0.77
HMS1Q12398 MCH5YOR306C 1566 nt10.24□□□□□ -0.77
HMS1Q12398 SOR2YDL246C 1074 nt10.21□□□□□ -0.77
HMS1Q12398 Q0182Q0182 405 nt10.21□□□□□ -0.77
HMS1Q12398 SOR1YJR159W 1074 nt10.21□□□□□ -0.77
HMS1Q12398 FRD1YEL047C 1413 nt10.2□□□□□ -0.78
HMS1Q12398 SPP1YPL138C 1062 nt10.16□□□□□ -0.78
HMS1Q12398 PCM1YEL058W 1674 nt10.15□□□□□ -0.78
HMS1Q12398 CWP1YKL096W 720 nt10.15□□□□□ -0.78
HMS1Q12398 ADH2YMR303C 1047 nt10.15□□□□□ -0.78
HMS1Q12398 YCL042WYCL042W 360 nt10.14□□□□□ -0.79
HMS1Q12398 PIB2YGL023C 1908 nt10.13□□□□□ -0.79
HMS1Q12398 NCP1YHR042W 2076 nt10.08□□□□□ -0.8
HMS1Q12398 LCB1YMR296C 1677 nt10.07□□□□□ -0.8
HMS1Q12398 SNF6YHL025W 999 nt10.07□□□□□ -0.8
HMS1Q12398 RTF1YGL244W 1677 nt10.06□□□□□ -0.8
HMS1Q12398 BOP3YNL042W 1191 nt10.03□□□□□ -0.8
HMS1Q12398 SIM1YIL123W 1431 nt10□□□□□ -0.81
HMS1Q12398 BIO4YNR057C 714 nt10□□□□□ -0.81
HMS1Q12398 YIH1YCR059C 777 nt9.99□□□□□ -0.81
HMS1Q12398 PTH1YHR189W 573 nt9.97□□□□□ -0.81
HMS1Q12398 RNQ1YCL028W 1218 nt9.97□□□□□ -0.81
HMS1Q12398 DIC1YLR348C 897 nt9.95□□□□□ -0.82
HMS1Q12398 RTG1YOL067C 534 nt9.95□□□□□ -0.82
HMS1Q12398 YLR235CYLR235C 399 nt9.94□□□□□ -0.82
HMS1Q12398 RPM1RPM1 483 nt9.94□□□□□ -0.82
HMS1Q12398 PTK1YKL198C 1989 nt9.93□□□□□ -0.82
HMS1Q12398 ALG12YNR030W 1656 nt9.9□□□□□ -0.82
HMS1Q12398 YLL053CYLL053C 459 nt9.9□□□□□ -0.82
HMS1Q12398 LYS4YDR234W 2082 nt9.87□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.86□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 YEL076CYEL076C 651 nt9.86□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 MRPL8YJL063C 717 nt9.86□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 YKL030WYKL030W 606 nt9.86□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 YLR464WYLR464W 651 nt9.86□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 ERF2YLR246W 1080 nt9.84□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 TIM23YNR017W 669 nt9.84□□□□□ -0.83
HMS1Q12398 FTR1YER145C 1215 nt9.83□□□□□ -0.84
HMS1Q12398 CRR1YLR213C 1269 nt9.83□□□□□ -0.84
HMS1Q12398 GAL1YBR020W 1587 nt9.81□□□□□ -0.84
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