Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.16□□□□□ -0.62
TY1A-NL1Q12391 YGR021WYGR021W 873 nt11.14□□□□□ -0.63
TY1A-NL1Q12391 GIS3YLR094C 1509 nt11.11□□□□□ -0.63
TY1A-NL1Q12391 GFD2YCL036W 1701 nt11.1□□□□□ -0.63
TY1A-NL1Q12391 ART5YGR068C 1761 nt11.09□□□□□ -0.63
TY1A-NL1Q12391 HOM6YJR139C 1080 nt11.08□□□□□ -0.64
TY1A-NL1Q12391 PCH2YBR186W 1695 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1A-NL1Q12391 SHU1YHL006C 453 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1A-NL1Q12391 SEC11YIR022W 504 nt11.06□□□□□ -0.64
TY1A-NL1Q12391 RTS2YOR077W 699 nt11.03□□□□□ -0.64
TY1A-NL1Q12391 GUT2YIL155C 1950 nt11.03□□□□□ -0.64
TY1A-NL1Q12391 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11□□□□□ -0.65
TY1A-NL1Q12391 PET9YBL030C 957 nt10.99□□□□□ -0.65
TY1A-NL1Q12391 MNP1YGL068W 585 nt10.97□□□□□ -0.65
TY1A-NL1Q12391 YSC84YHR016C 1407 nt10.96□□□□□ -0.65
TY1A-NL1Q12391 PAC11YDR488C 1602 nt10.94□□□□□ -0.66
TY1A-NL1Q12391 YCH1YGR203W 447 nt10.93□□□□□ -0.66
TY1A-NL1Q12391 TIR4YOR009W 1464 nt10.93□□□□□ -0.66
TY1A-NL1Q12391 RKM5YLR137W 1104 nt10.92□□□□□ -0.66
TY1A-NL1Q12391 CUE1YMR264W 612 nt10.91□□□□□ -0.66
TY1A-NL1Q12391 YHL050CYHL050C 2094 nt10.9□□□□□ -0.66
TY1A-NL1Q12391 PIB2YGL023C 1908 nt10.86□□□□□ -0.67
TY1A-NL1Q12391 YMR057CYMR057C 372 nt10.83□□□□□ -0.68
TY1A-NL1Q12391 RRT12YCR045C 1476 nt10.81□□□□□ -0.68
TY1A-NL1Q12391 YIL100WYIL100W 354 nt10.79□□□□□ -0.68
TY1A-NL1Q12391 FPS1YLL043W 2010 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1A-NL1Q12391 RTF1YGL244W 1677 nt10.78□□□□□ -0.68
TY1A-NL1Q12391 YNL195CYNL195C 786 nt10.77□□□□□ -0.69
TY1A-NL1Q12391 NPL3YDR432W 1245 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1A-NL1Q12391 YKL097CYKL097C 411 nt10.75□□□□□ -0.69
TY1A-NL1Q12391 CSM2YIL132C 642 nt10.71□□□□□ -0.69
TY1A-NL1Q12391 YLR236CYLR236C 324 nt10.71□□□□□ -0.69
TY1A-NL1Q12391 BOP3YNL042W 1191 nt10.69□□□□□ -0.7
TY1A-NL1Q12391 YJL152WYJL152W 360 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1A-NL1Q12391 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.67□□□□□ -0.7
TY1A-NL1Q12391 YOL037CYOL037C 354 nt10.63□□□□□ -0.71
TY1A-NL1Q12391 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.62□□□□□ -0.71
TY1A-NL1Q12391 PTK1YKL198C 1989 nt10.61□□□□□ -0.71
TY1A-NL1Q12391 NCP1YHR042W 2076 nt10.57□□□□□ -0.72
TY1A-NL1Q12391 NVJ2YPR091C 2313 nt10.49□□□□□ -0.73
TY1A-NL1Q12391 PAU21YOR394W 495 nt10.46□□□□□ -0.73
TY1A-NL1Q12391 PAU22YPL282C 495 nt10.46□□□□□ -0.73
TY1A-NL1Q12391 LCB1YMR296C 1677 nt10.44□□□□□ -0.74
TY1A-NL1Q12391 WHI5YOR083W 888 nt10.41□□□□□ -0.74
TY1A-NL1Q12391 YOR139CYOR139C 393 nt10.4□□□□□ -0.74
TY1A-NL1Q12391 YFL054CYFL054C 1941 nt10.39□□□□□ -0.75
TY1A-NL1Q12391 RRD1YIL153W 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
TY1A-NL1Q12391 YLR281CYLR281C 468 nt10.38□□□□□ -0.75
TY1A-NL1Q12391 IDH1YNL037C 1083 nt10.37□□□□□ -0.75
TY1A-NL1Q12391 ARO7YPR060C 771 nt10.36□□□□□ -0.75
TY1A-NL1Q12391 FMP52YER004W 696 nt10.34□□□□□ -0.75
TY1A-NL1Q12391 SPT8YLR055C 1809 nt10.34□□□□□ -0.75
TY1A-NL1Q12391 GBP2YCL011C 1284 nt10.33□□□□□ -0.76
TY1A-NL1Q12391 DED1YOR204W 1815 nt10.3□□□□□ -0.76
TY1A-NL1Q12391 YJL225CYJL225C 5277 nt10.28□□□□□ -0.76
TY1A-NL1Q12391 PCM1YEL058W 1674 nt10.28□□□□□ -0.76
TY1A-NL1Q12391 SIM1YIL123W 1431 nt10.28□□□□□ -0.76
TY1A-NL1Q12391 TCD2YKL027W 1344 nt10.28□□□□□ -0.76
TY1A-NL1Q12391 LYS4YDR234W 2082 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1A-NL1Q12391 FMT1YBL013W 1206 nt10.23□□□□□ -0.77
TY1A-NL1Q12391 IMP2'YIL154C 1041 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 ADH2YMR303C 1047 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 BIO4YNR057C 714 nt10.19□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 SNF6YHL025W 999 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 CWP1YKL096W 720 nt10.18□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 DSK2YMR276W 1122 nt10.17□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 SWE1YJL187C 2460 nt10.16□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 BOR1YNL275W 1731 nt10.16□□□□□ -0.78
TY1A-NL1Q12391 YDR433WYDR433W 441 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-NL1Q12391 PUS2YGL063W 1113 nt10.13□□□□□ -0.79
TY1A-NL1Q12391 SOR2YDL246C 1074 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-NL1Q12391 SOR1YJR159W 1074 nt10.12□□□□□ -0.79
TY1A-NL1Q12391 MXR2YCL033C 507 nt10.11□□□□□ -0.79
TY1A-NL1Q12391 FMP45YDL222C 930 nt10.08□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 PAM17YKR065C 594 nt10.08□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 ERF2YLR246W 1080 nt10.07□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 CRR1YLR213C 1269 nt10.06□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 YPR011CYPR011C 981 nt10.06□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 YCL042WYCL042W 360 nt10.05□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 YIH1YCR059C 777 nt10.04□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 REG2YBR050C 1017 nt10.03□□□□□ -0.8
TY1A-NL1Q12391 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 ERV46YAL042W 1248 nt10.02□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 HSP60YLR259C 1719 nt10□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 YLL053CYLL053C 459 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 LPX1YOR084W 1164 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 RNQ1YCL028W 1218 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 FRD1YEL047C 1413 nt9.99□□□□□ -0.81
TY1A-NL1Q12391 YKR040CYKR040C 504 nt9.96□□□□□ -0.82
TY1A-NL1Q12391 HEM12YDR047W 1089 nt9.94□□□□□ -0.82
TY1A-NL1Q12391 ATF2YGR177C 1608 nt9.93□□□□□ -0.82
TY1A-NL1Q12391 MIC10YCL057C-A 294 nt9.93□□□□□ -0.82
TY1A-NL1Q12391 SNG1YGR197C 1644 nt9.9□□□□□ -0.82
TY1A-NL1Q12391 GLK1YCL040W 1503 nt9.9□□□□□ -0.82
TY1A-NL1Q12391 FTR1YER145C 1215 nt9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms