Protein–RNA interactions for Protein: Q12380

ATG5, Autophagy protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG5Q12380 HOM6YJR139C 1080 nt10.34□□□□□ -0.75
ATG5Q12380 IRC15YPL017C 1500 nt10.32□□□□□ -0.76
ATG5Q12380 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.31□□□□□ -0.76
ATG5Q12380 SCC4YER147C 1875 nt10.26□□□□□ -0.77
ATG5Q12380 PCH2YBR186W 1695 nt10.25□□□□□ -0.77
ATG5Q12380 GFD2YCL036W 1701 nt10.24□□□□□ -0.77
ATG5Q12380 ART5YGR068C 1761 nt10.24□□□□□ -0.77
ATG5Q12380 GIS3YLR094C 1509 nt10.23□□□□□ -0.77
ATG5Q12380 GUT2YIL155C 1950 nt10.23□□□□□ -0.77
ATG5Q12380 MNP1YGL068W 585 nt10.22□□□□□ -0.77
ATG5Q12380 SEC11YIR022W 504 nt10.19□□□□□ -0.78
ATG5Q12380 RKM5YLR137W 1104 nt10.17□□□□□ -0.78
ATG5Q12380 PET9YBL030C 957 nt10.17□□□□□ -0.78
ATG5Q12380 RTS2YOR077W 699 nt10.14□□□□□ -0.79
ATG5Q12380 TIR4YOR009W 1464 nt10.12□□□□□ -0.79
ATG5Q12380 YKL097CYKL097C 411 nt10.11□□□□□ -0.79
ATG5Q12380 YCH1YGR203W 447 nt10.1□□□□□ -0.79
ATG5Q12380 CUE1YMR264W 612 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG5Q12380 PIB2YGL023C 1908 nt10.07□□□□□ -0.8
ATG5Q12380 YSC84YHR016C 1407 nt10.06□□□□□ -0.8
ATG5Q12380 YHL050CYHL050C 2094 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG5Q12380 NPL3YDR432W 1245 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG5Q12380 YMR057CYMR057C 372 nt10.02□□□□□ -0.81
ATG5Q12380 UME6YDR207C 2511 nt10.01□□□□□ -0.81
ATG5Q12380 RRT12YCR045C 1476 nt9.96□□□□□ -0.82
ATG5Q12380 RTF1YGL244W 1677 nt9.94□□□□□ -0.82
ATG5Q12380 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG5Q12380 YOL037CYOL037C 354 nt9.92□□□□□ -0.82
ATG5Q12380 YIL100WYIL100W 354 nt9.9□□□□□ -0.82
ATG5Q12380 YJL152WYJL152W 360 nt9.87□□□□□ -0.83
ATG5Q12380 YNL195CYNL195C 786 nt9.87□□□□□ -0.83
ATG5Q12380 YLR236CYLR236C 324 nt9.86□□□□□ -0.83
ATG5Q12380 BOP3YNL042W 1191 nt9.82□□□□□ -0.84
ATG5Q12380 YOR139CYOR139C 393 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG5Q12380 PTK1YKL198C 1989 nt9.81□□□□□ -0.84
ATG5Q12380 YJL225CYJL225C 5277 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG5Q12380 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.8□□□□□ -0.84
ATG5Q12380 BOR1YNL275W 1731 nt9.79□□□□□ -0.84
ATG5Q12380 NCP1YHR042W 2076 nt9.76□□□□□ -0.85
ATG5Q12380 WHI5YOR083W 888 nt9.74□□□□□ -0.85
ATG5Q12380 YLR281CYLR281C 468 nt9.73□□□□□ -0.85
ATG5Q12380 RRD1YIL153W 1182 nt9.66□□□□□ -0.86
ATG5Q12380 LCB1YMR296C 1677 nt9.63□□□□□ -0.87
ATG5Q12380 MCH5YOR306C 1566 nt9.62□□□□□ -0.87
ATG5Q12380 IDH1YNL037C 1083 nt9.61□□□□□ -0.87
ATG5Q12380 DED1YOR204W 1815 nt9.6□□□□□ -0.87
ATG5Q12380 GBP2YCL011C 1284 nt9.59□□□□□ -0.87
ATG5Q12380 FMP52YER004W 696 nt9.58□□□□□ -0.88
ATG5Q12380 YFL054CYFL054C 1941 nt9.57□□□□□ -0.88
ATG5Q12380 SPT8YLR055C 1809 nt9.54□□□□□ -0.88
ATG5Q12380 TCD2YKL027W 1344 nt9.54□□□□□ -0.88
ATG5Q12380 FMT1YBL013W 1206 nt9.53□□□□□ -0.88
ATG5Q12380 IMP2'YIL154C 1041 nt9.52□□□□□ -0.89
ATG5Q12380 PCM1YEL058W 1674 nt9.51□□□□□ -0.89
ATG5Q12380 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG5Q12380 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG5Q12380 PUS2YGL063W 1113 nt9.5□□□□□ -0.89
ATG5Q12380 DSK2YMR276W 1122 nt9.49□□□□□ -0.89
ATG5Q12380 SIM1YIL123W 1431 nt9.47□□□□□ -0.89
ATG5Q12380 YPR011CYPR011C 981 nt9.46□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 LYS4YDR234W 2082 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 ADH2YMR303C 1047 nt9.45□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 Q0182Q0182 405 nt9.44□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 ALG12YNR030W 1656 nt9.44□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 FMP45YDL222C 930 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 YDR433WYDR433W 441 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 CWP1YKL096W 720 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 MXR2YCL033C 507 nt9.42□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 SOR2YDL246C 1074 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 SOR1YJR159W 1074 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 BIO4YNR057C 714 nt9.41□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 SNF6YHL025W 999 nt9.4□□□□□ -0.9
ATG5Q12380 HSP60YLR259C 1719 nt9.38□□□□□ -0.91
ATG5Q12380 ERV46YAL042W 1248 nt9.37□□□□□ -0.91
ATG5Q12380 LPX1YOR084W 1164 nt9.34□□□□□ -0.91
ATG5Q12380 SWE1YJL187C 2460 nt9.33□□□□□ -0.92
ATG5Q12380 YIH1YCR059C 777 nt9.32□□□□□ -0.92
ATG5Q12380 YCL042WYCL042W 360 nt9.32□□□□□ -0.92
ATG5Q12380 FRD1YEL047C 1413 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG5Q12380 YKR040CYKR040C 504 nt9.31□□□□□ -0.92
ATG5Q12380 CRR1YLR213C 1269 nt9.28□□□□□ -0.92
ATG5Q12380 ERF2YLR246W 1080 nt9.28□□□□□ -0.92
ATG5Q12380 YLL053CYLL053C 459 nt9.26□□□□□ -0.93
ATG5Q12380 RNQ1YCL028W 1218 nt9.26□□□□□ -0.93
ATG5Q12380 GLK1YCL040W 1503 nt9.23□□□□□ -0.93
ATG5Q12380 ATF2YGR177C 1608 nt9.2□□□□□ -0.94
ATG5Q12380 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.2□□□□□ -0.94
ATG5Q12380 MIC10YCL057C-A 294 nt9.18□□□□□ -0.94
ATG5Q12380 FTR1YER145C 1215 nt9.17□□□□□ -0.94
ATG5Q12380 HEM12YDR047W 1089 nt9.16□□□□□ -0.94
ATG5Q12380 DIC1YLR348C 897 nt9.16□□□□□ -0.94
ATG5Q12380 SNG1YGR197C 1644 nt9.15□□□□□ -0.94
ATG5Q12380 NAR1YNL240C 1476 nt9.15□□□□□ -0.95
ATG5Q12380 YFL067WYFL067W 528 nt9.14□□□□□ -0.95
ATG5Q12380 GAL1YBR020W 1587 nt9.14□□□□□ -0.95
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