Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 ADO1YJR105W 1023 nt15.54■□□□□ 0.08
MSB4Q12317 PHO4YFR034C 939 nt15.51■□□□□ 0.07
MSB4Q12317 VAR1Q0140 1197 nt15.51■□□□□ 0.07
MSB4Q12317 UBX6YJL048C 1191 nt15.48■□□□□ 0.07
MSB4Q12317 CCT6YDR188W 1641 nt15.47■□□□□ 0.07
MSB4Q12317 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.46■□□□□ 0.07
MSB4Q12317 YEL076CYEL076C 651 nt15.46■□□□□ 0.07
MSB4Q12317 YLR464WYLR464W 651 nt15.46■□□□□ 0.07
MSB4Q12317 LPX1YOR084W 1164 nt15.41■□□□□ 0.06
MSB4Q12317 SPP1YPL138C 1062 nt15.39■□□□□ 0.05
MSB4Q12317 YJL152WYJL152W 360 nt15.36■□□□□ 0.05
MSB4Q12317 ERV46YAL042W 1248 nt15.34■□□□□ 0.05
MSB4Q12317 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.32■□□□□ 0.04
MSB4Q12317 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.32■□□□□ 0.04
MSB4Q12317 RTG1YOL067C 534 nt15.31■□□□□ 0.04
MSB4Q12317 SIS1YNL007C 1059 nt15.3■□□□□ 0.04
MSB4Q12317 IDH1YNL037C 1083 nt15.28■□□□□ 0.04
MSB4Q12317 ALF1YNL148C 765 nt15.27■□□□□ 0.04
MSB4Q12317 YDR433WYDR433W 441 nt15.24■□□□□ 0.03
MSB4Q12317 YKR040CYKR040C 504 nt15.18■□□□□ 0.02
MSB4Q12317 HUA1YGR268C 597 nt15.07■□□□□ 0
MSB4Q12317 GBP2YCL011C 1284 nt15.07■□□□□ 0
MSB4Q12317 YDR094WYDR094W 336 nt15.04■□□□□ -0
MSB4Q12317 SPT5YML010W 3192 nt15.04■□□□□ -0
MSB4Q12317 MXR2YCL033C 507 nt15.02■□□□□ -0
MSB4Q12317 YDR095CYDR095C 411 nt14.97□□□□□ -0.01
MSB4Q12317 YPS1YLR120C 1710 nt14.96□□□□□ -0.01
MSB4Q12317 TIR4YOR009W 1464 nt14.95□□□□□ -0.02
MSB4Q12317 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.94□□□□□ -0.02
MSB4Q12317 NME1NME1 340 nt14.89□□□□□ -0.03
MSB4Q12317 CAC2YML102W 1407 nt14.82□□□□□ -0.04
MSB4Q12317 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.8□□□□□ -0.04
MSB4Q12317 TCD2YKL027W 1344 nt14.79□□□□□ -0.04
MSB4Q12317 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.78□□□□□ -0.04
MSB4Q12317 YDR509WYDR509W 348 nt14.74□□□□□ -0.05
MSB4Q12317 YMR057CYMR057C 372 nt14.74□□□□□ -0.05
MSB4Q12317 CSM2YIL132C 642 nt14.72□□□□□ -0.05
MSB4Q12317 RPP2AYOL039W 321 nt14.72□□□□□ -0.05
MSB4Q12317 ART5YGR068C 1761 nt14.7□□□□□ -0.06
MSB4Q12317 SSA4YER103W 1929 nt14.69□□□□□ -0.06
MSB4Q12317 FRD1YEL047C 1413 nt14.68□□□□□ -0.06
MSB4Q12317 Q0182Q0182 405 nt14.68□□□□□ -0.06
MSB4Q12317 PET9YBL030C 957 nt14.68□□□□□ -0.06
MSB4Q12317 PTH1YHR189W 573 nt14.65□□□□□ -0.06
MSB4Q12317 YKL030WYKL030W 606 nt14.63□□□□□ -0.07
MSB4Q12317 DED1YOR204W 1815 nt14.59□□□□□ -0.07
MSB4Q12317 PAM17YKR065C 594 nt14.58□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 SBA1YKL117W 651 nt14.57□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 YLR235CYLR235C 399 nt14.57□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 PTP1YDL230W 1008 nt14.56□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 PAU21YOR394W 495 nt14.55□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 PAU22YPL282C 495 nt14.55□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 GFD2YCL036W 1701 nt14.55□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 YCL042WYCL042W 360 nt14.53□□□□□ -0.08
MSB4Q12317 RRD1YIL153W 1182 nt14.52□□□□□ -0.09
MSB4Q12317 LCB1YMR296C 1677 nt14.49□□□□□ -0.09
MSB4Q12317 PAU16YKL224C 372 nt14.47□□□□□ -0.09
MSB4Q12317 ARO7YPR060C 771 nt14.45□□□□□ -0.1
MSB4Q12317 SOR2YDL246C 1074 nt14.41□□□□□ -0.1
MSB4Q12317 SOR1YJR159W 1074 nt14.41□□□□□ -0.1
MSB4Q12317 FMT1YBL013W 1206 nt14.4□□□□□ -0.1
MSB4Q12317 FPS1YLL043W 2010 nt14.4□□□□□ -0.1
MSB4Q12317 RRT5YFR032C 870 nt14.38□□□□□ -0.11
MSB4Q12317 MEP2YNL142W 1500 nt14.36□□□□□ -0.11
MSB4Q12317 YFR018CYFR018C 1092 nt14.36□□□□□ -0.11
MSB4Q12317 RTS2YOR077W 699 nt14.31□□□□□ -0.12
MSB4Q12317 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt14.3□□□□□ -0.12
MSB4Q12317 Q0144Q0144 330 nt14.29□□□□□ -0.12
MSB4Q12317 PRE6YOL038W 765 nt14.28□□□□□ -0.12
MSB4Q12317 BDF1YLR399C 2061 nt14.24□□□□□ -0.13
MSB4Q12317 CWP1YKL096W 720 nt14.23□□□□□ -0.13
MSB4Q12317 TIM23YNR017W 669 nt14.22□□□□□ -0.13
MSB4Q12317 FMP52YER004W 696 nt14.2□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 DCW1YKL046C 1350 nt14.17□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 DIC1YLR348C 897 nt14.16□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 CUE1YMR264W 612 nt14.16□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 REG2YBR050C 1017 nt14.16□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 Q0017Q0017 162 nt14.16□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 SNF6YHL025W 999 nt14.15□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 ADH2YMR303C 1047 nt14.15□□□□□ -0.14
MSB4Q12317 Q0142Q0142 177 nt14.14□□□□□ -0.15
MSB4Q12317 BUR6YER159C 429 nt14.13□□□□□ -0.15
MSB4Q12317 YLR179CYLR179C 606 nt14.12□□□□□ -0.15
MSB4Q12317 BMT5YIL096C 1011 nt14.11□□□□□ -0.15
MSB4Q12317 YPR064WYPR064W 420 nt14.11□□□□□ -0.15
MSB4Q12317 IRC15YPL017C 1500 nt14.1□□□□□ -0.15
MSB4Q12317 TAD3YLR316C 969 nt14.03□□□□□ -0.16
MSB4Q12317 EMI2YDR516C 1503 nt14.03□□□□□ -0.16
MSB4Q12317 YIL100WYIL100W 354 nt14.02□□□□□ -0.17
MSB4Q12317 TAT1YBR069C 1860 nt14.01□□□□□ -0.17
MSB4Q12317 YFL066CYFL066C 1179 nt14□□□□□ -0.17
MSB4Q12317 NAT4YMR069W 858 nt14□□□□□ -0.17
MSB4Q12317 YDL221WYDL221W 552 nt13.99□□□□□ -0.17
MSB4Q12317 SEM1YDR363W-A 270 nt13.99□□□□□ -0.17
MSB4Q12317 GIS3YLR094C 1509 nt13.99□□□□□ -0.17
MSB4Q12317 PCM1YEL058W 1674 nt13.95□□□□□ -0.18
MSB4Q12317 WSC2YNL283C 1512 nt13.94□□□□□ -0.18
MSB4Q12317 AHT1YHR093W 549 nt13.92□□□□□ -0.18
MSB4Q12317 RNQ1YCL028W 1218 nt13.92□□□□□ -0.18
MSB4Q12317 PEX25YPL112C 1185 nt13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 80.5 ms