Protein–RNA interactions for Protein: Q12301

YDL180W, Uncharacterized membrane protein YDL180W, yeastyeast

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL180WQ12301 MEP2YNL142W 1500 nt10.82□□□□□ -0.68
YDL180WQ12301 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.81□□□□□ -0.68
YDL180WQ12301 SSA4YER103W 1929 nt10.79□□□□□ -0.68
YDL180WQ12301 RPP2AYOL039W 321 nt10.77□□□□□ -0.69
YDL180WQ12301 IMP2'YIL154C 1041 nt10.72□□□□□ -0.69
YDL180WQ12301 YJL152WYJL152W 360 nt10.68□□□□□ -0.7
YDL180WQ12301 PTP1YDL230W 1008 nt10.67□□□□□ -0.7
YDL180WQ12301 DSK2YMR276W 1122 nt10.67□□□□□ -0.7
YDL180WQ12301 YCH1YGR203W 447 nt10.64□□□□□ -0.71
YDL180WQ12301 TIR4YOR009W 1464 nt10.63□□□□□ -0.71
YDL180WQ12301 DCW1YKL046C 1350 nt10.61□□□□□ -0.71
YDL180WQ12301 PET9YBL030C 957 nt10.6□□□□□ -0.71
YDL180WQ12301 ART5YGR068C 1761 nt10.6□□□□□ -0.71
YDL180WQ12301 YLR236CYLR236C 324 nt10.58□□□□□ -0.72
YDL180WQ12301 IDH1YNL037C 1083 nt10.56□□□□□ -0.72
YDL180WQ12301 GFD2YCL036W 1701 nt10.55□□□□□ -0.72
YDL180WQ12301 FMP45YDL222C 930 nt10.55□□□□□ -0.72
YDL180WQ12301 YPR011CYPR011C 981 nt10.55□□□□□ -0.72
YDL180WQ12301 CAC2YML102W 1407 nt10.54□□□□□ -0.72
YDL180WQ12301 EMI2YDR516C 1503 nt10.53□□□□□ -0.72
YDL180WQ12301 MOT3YMR070W 1473 nt10.51□□□□□ -0.73
YDL180WQ12301 YMR057CYMR057C 372 nt10.49□□□□□ -0.73
YDL180WQ12301 YMR090WYMR090W 684 nt10.49□□□□□ -0.73
YDL180WQ12301 YDL221WYDL221W 552 nt10.47□□□□□ -0.73
YDL180WQ12301 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.47□□□□□ -0.73
YDL180WQ12301 ERV46YAL042W 1248 nt10.44□□□□□ -0.74
YDL180WQ12301 BDF1YLR399C 2061 nt10.43□□□□□ -0.74
YDL180WQ12301 GBP2YCL011C 1284 nt10.43□□□□□ -0.74
YDL180WQ12301 IRC15YPL017C 1500 nt10.4□□□□□ -0.74
YDL180WQ12301 YDR433WYDR433W 441 nt10.4□□□□□ -0.74
YDL180WQ12301 RTS2YOR077W 699 nt10.4□□□□□ -0.74
YDL180WQ12301 LPX1YOR084W 1164 nt10.4□□□□□ -0.74
YDL180WQ12301 FPS1YLL043W 2010 nt10.35□□□□□ -0.75
YDL180WQ12301 CUE1YMR264W 612 nt10.35□□□□□ -0.75
YDL180WQ12301 YKR040CYKR040C 504 nt10.34□□□□□ -0.75
YDL180WQ12301 TCD2YKL027W 1344 nt10.33□□□□□ -0.76
YDL180WQ12301 GIS3YLR094C 1509 nt10.32□□□□□ -0.76
YDL180WQ12301 SDH1YKL148C 1923 nt10.31□□□□□ -0.76
YDL180WQ12301 TAT1YBR069C 1860 nt10.29□□□□□ -0.76
YDL180WQ12301 MXR2YCL033C 507 nt10.27□□□□□ -0.77
YDL180WQ12301 YBR220CYBR220C 1683 nt10.27□□□□□ -0.77
YDL180WQ12301 SCC4YER147C 1875 nt10.27□□□□□ -0.77
YDL180WQ12301 YIL100WYIL100W 354 nt10.24□□□□□ -0.77
YDL180WQ12301 RRD1YIL153W 1182 nt10.23□□□□□ -0.77
YDL180WQ12301 DED1YOR204W 1815 nt10.21□□□□□ -0.77
YDL180WQ12301 MRPL8YJL063C 717 nt10.19□□□□□ -0.78
YDL180WQ12301 SPP1YPL138C 1062 nt10.19□□□□□ -0.78
YDL180WQ12301 FMP52YER004W 696 nt10.16□□□□□ -0.78
YDL180WQ12301 YCL042WYCL042W 360 nt10.13□□□□□ -0.79
YDL180WQ12301 FRD1YEL047C 1413 nt10.13□□□□□ -0.79
YDL180WQ12301 SOR2YDL246C 1074 nt10.12□□□□□ -0.79
YDL180WQ12301 SOR1YJR159W 1074 nt10.12□□□□□ -0.79
YDL180WQ12301 FMT1YBL013W 1206 nt10.1□□□□□ -0.79
YDL180WQ12301 ADO1YJR105W 1023 nt10.08□□□□□ -0.8
YDL180WQ12301 YNL195CYNL195C 786 nt10.08□□□□□ -0.8
YDL180WQ12301 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.07□□□□□ -0.8
YDL180WQ12301 YEL076CYEL076C 651 nt10.07□□□□□ -0.8
YDL180WQ12301 YLR464WYLR464W 651 nt10.07□□□□□ -0.8
YDL180WQ12301 RTG1YOL067C 534 nt10.07□□□□□ -0.8
YDL180WQ12301 PAC11YDR488C 1602 nt10.05□□□□□ -0.8
YDL180WQ12301 CWP1YKL096W 720 nt10.01□□□□□ -0.81
YDL180WQ12301 YLR235CYLR235C 399 nt9.99□□□□□ -0.81
YDL180WQ12301 ADH2YMR303C 1047 nt9.99□□□□□ -0.81
YDL180WQ12301 YSC84YHR016C 1407 nt9.98□□□□□ -0.81
YDL180WQ12301 PCM1YEL058W 1674 nt9.96□□□□□ -0.81
YDL180WQ12301 SNF6YHL025W 999 nt9.95□□□□□ -0.82
YDL180WQ12301 PTH1YHR189W 573 nt9.95□□□□□ -0.82
YDL180WQ12301 SEC11YIR022W 504 nt9.95□□□□□ -0.82
YDL180WQ12301 RRT12YCR045C 1476 nt9.95□□□□□ -0.82
YDL180WQ12301 HUA1YGR268C 597 nt9.93□□□□□ -0.82
YDL180WQ12301 YKL030WYKL030W 606 nt9.92□□□□□ -0.82
YDL180WQ12301 YHL050CYHL050C 2094 nt9.92□□□□□ -0.82
YDL180WQ12301 PCH2YBR186W 1695 nt9.9□□□□□ -0.83
YDL180WQ12301 DIC1YLR348C 897 nt9.87□□□□□ -0.83
YDL180WQ12301 GUT2YIL155C 1950 nt9.86□□□□□ -0.83
YDL180WQ12301 YIH1YCR059C 777 nt9.85□□□□□ -0.83
YDL180WQ12301 RNQ1YCL028W 1218 nt9.85□□□□□ -0.83
YDL180WQ12301 LCB1YMR296C 1677 nt9.85□□□□□ -0.83
YDL180WQ12301 TIM23YNR017W 669 nt9.83□□□□□ -0.84
YDL180WQ12301 SIM1YIL123W 1431 nt9.79□□□□□ -0.84
YDL180WQ12301 BIO4YNR057C 714 nt9.78□□□□□ -0.84
YDL180WQ12301 YJL225CYJL225C 5277 nt9.78□□□□□ -0.84
YDL180WQ12301 YLR179CYLR179C 606 nt9.76□□□□□ -0.85
YDL180WQ12301 NVJ2YPR091C 2313 nt9.76□□□□□ -0.85
YDL180WQ12301 YLL053CYLL053C 459 nt9.74□□□□□ -0.85
YDL180WQ12301 PIB2YGL023C 1908 nt9.74□□□□□ -0.85
YDL180WQ12301 YPR064WYPR064W 420 nt9.72□□□□□ -0.85
YDL180WQ12301 AQY1YPR192W 918 nt9.72□□□□□ -0.85
YDL180WQ12301 FTR1YER145C 1215 nt9.7□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 YDR094WYDR094W 336 nt9.69□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.69□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 UBX6YJL048C 1191 nt9.68□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 AHT1YHR093W 549 nt9.67□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 ERF2YLR246W 1080 nt9.66□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 BOP3YNL042W 1191 nt9.66□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 WSC2YNL283C 1512 nt9.66□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 TAD3YLR316C 969 nt9.65□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 GAL1YBR020W 1587 nt9.65□□□□□ -0.86
YDL180WQ12301 NCP1YHR042W 2076 nt9.65□□□□□ -0.87
YDL180WQ12301 RTF1YGL244W 1677 nt9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.8 ms