Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 EMI2YDR516C 1503 nt11.88□□□□□ -0.51
RRP42Q12277 CAC2YML102W 1407 nt11.86□□□□□ -0.51
RRP42Q12277 ART5YGR068C 1761 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP42Q12277 YJL152WYJL152W 360 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP42Q12277 YMR090WYMR090W 684 nt11.85□□□□□ -0.51
RRP42Q12277 TIR4YOR009W 1464 nt11.83□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 YCH1YGR203W 447 nt11.81□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 PET9YBL030C 957 nt11.81□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 GFD2YCL036W 1701 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 YDL221WYDL221W 552 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.8□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 PUS2YGL063W 1113 nt11.79□□□□□ -0.52
RRP42Q12277 YMR057CYMR057C 372 nt11.71□□□□□ -0.53
RRP42Q12277 RTS2YOR077W 699 nt11.7□□□□□ -0.54
RRP42Q12277 IRC15YPL017C 1500 nt11.69□□□□□ -0.54
RRP42Q12277 IMP2'YIL154C 1041 nt11.67□□□□□ -0.54
RRP42Q12277 DSK2YMR276W 1122 nt11.66□□□□□ -0.54
RRP42Q12277 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.65□□□□□ -0.54
RRP42Q12277 SDH1YKL148C 1923 nt11.64□□□□□ -0.55
RRP42Q12277 YBR220CYBR220C 1683 nt11.63□□□□□ -0.55
RRP42Q12277 IDH1YNL037C 1083 nt11.63□□□□□ -0.55
RRP42Q12277 GIS3YLR094C 1509 nt11.61□□□□□ -0.55
RRP42Q12277 SCC4YER147C 1875 nt11.58□□□□□ -0.56
RRP42Q12277 CUE1YMR264W 612 nt11.58□□□□□ -0.56
RRP42Q12277 YLR236CYLR236C 324 nt11.57□□□□□ -0.56
RRP42Q12277 GBP2YCL011C 1284 nt11.53□□□□□ -0.56
RRP42Q12277 FPS1YLL043W 2010 nt11.53□□□□□ -0.56
RRP42Q12277 YPR011CYPR011C 981 nt11.51□□□□□ -0.57
RRP42Q12277 FMP45YDL222C 930 nt11.5□□□□□ -0.57
RRP42Q12277 YIL100WYIL100W 354 nt11.48□□□□□ -0.57
RRP42Q12277 YDR433WYDR433W 441 nt11.46□□□□□ -0.57
RRP42Q12277 BDF1YLR399C 2061 nt11.43□□□□□ -0.58
RRP42Q12277 TCD2YKL027W 1344 nt11.41□□□□□ -0.58
RRP42Q12277 LPX1YOR084W 1164 nt11.4□□□□□ -0.58
RRP42Q12277 ERV46YAL042W 1248 nt11.39□□□□□ -0.59
RRP42Q12277 YNL195CYNL195C 786 nt11.35□□□□□ -0.59
RRP42Q12277 MXR2YCL033C 507 nt11.34□□□□□ -0.59
RRP42Q12277 RRD1YIL153W 1182 nt11.33□□□□□ -0.6
RRP42Q12277 MOT3YMR070W 1473 nt11.32□□□□□ -0.6
RRP42Q12277 YKR040CYKR040C 504 nt11.32□□□□□ -0.6
RRP42Q12277 TAT1YBR069C 1860 nt11.32□□□□□ -0.6
RRP42Q12277 YSC84YHR016C 1407 nt11.3□□□□□ -0.6
RRP42Q12277 DED1YOR204W 1815 nt11.28□□□□□ -0.6
RRP42Q12277 SEC11YIR022W 504 nt11.27□□□□□ -0.61
RRP42Q12277 PAC11YDR488C 1602 nt11.27□□□□□ -0.61
RRP42Q12277 NVJ2YPR091C 2313 nt11.26□□□□□ -0.61
RRP42Q12277 FMP52YER004W 696 nt11.24□□□□□ -0.61
RRP42Q12277 RRT12YCR045C 1476 nt11.24□□□□□ -0.61
RRP42Q12277 YCL042WYCL042W 360 nt11.2□□□□□ -0.62
RRP42Q12277 YHL050CYHL050C 2094 nt11.2□□□□□ -0.62
RRP42Q12277 FMT1YBL013W 1206 nt11.18□□□□□ -0.62
RRP42Q12277 PCH2YBR186W 1695 nt11.17□□□□□ -0.62
RRP42Q12277 SOR2YDL246C 1074 nt11.15□□□□□ -0.62
RRP42Q12277 SOR1YJR159W 1074 nt11.15□□□□□ -0.62
RRP42Q12277 CWP1YKL096W 720 nt11.14□□□□□ -0.63
RRP42Q12277 FRD1YEL047C 1413 nt11.14□□□□□ -0.63
RRP42Q12277 SPP1YPL138C 1062 nt11.12□□□□□ -0.63
RRP42Q12277 PCM1YEL058W 1674 nt11.09□□□□□ -0.63
RRP42Q12277 ADH2YMR303C 1047 nt11.09□□□□□ -0.63
RRP42Q12277 GUT2YIL155C 1950 nt11.08□□□□□ -0.64
RRP42Q12277 SNF6YHL025W 999 nt11.07□□□□□ -0.64
RRP42Q12277 SIM1YIL123W 1431 nt10.97□□□□□ -0.65
RRP42Q12277 PTH1YHR189W 573 nt10.96□□□□□ -0.65
RRP42Q12277 YLR235CYLR235C 399 nt10.95□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 BOP3YNL042W 1191 nt10.94□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 RTF1YGL244W 1677 nt10.94□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 LCB1YMR296C 1677 nt10.93□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 DIC1YLR348C 897 nt10.92□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 YIH1YCR059C 777 nt10.91□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 BIO4YNR057C 714 nt10.91□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 RNQ1YCL028W 1218 nt10.9□□□□□ -0.66
RRP42Q12277 RTG1YOL067C 534 nt10.88□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 MRPL8YJL063C 717 nt10.87□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 PIB2YGL023C 1908 nt10.86□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 YKL030WYKL030W 606 nt10.85□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 NCP1YHR042W 2076 nt10.85□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.84□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 YEL076CYEL076C 651 nt10.84□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 YLL053CYLL053C 459 nt10.84□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 YLR464WYLR464W 651 nt10.84□□□□□ -0.67
RRP42Q12277 TIM23YNR017W 669 nt10.82□□□□□ -0.68
RRP42Q12277 ADO1YJR105W 1023 nt10.81□□□□□ -0.68
RRP42Q12277 YLR179CYLR179C 606 nt10.78□□□□□ -0.68
RRP42Q12277 ERF2YLR246W 1080 nt10.77□□□□□ -0.69
RRP42Q12277 FTR1YER145C 1215 nt10.76□□□□□ -0.69
RRP42Q12277 HUA1YGR268C 597 nt10.75□□□□□ -0.69
RRP42Q12277 GAL1YBR020W 1587 nt10.72□□□□□ -0.69
RRP42Q12277 PTK1YKL198C 1989 nt10.71□□□□□ -0.69
RRP42Q12277 CRR1YLR213C 1269 nt10.71□□□□□ -0.69
RRP42Q12277 AQY1YPR192W 918 nt10.71□□□□□ -0.69
RRP42Q12277 TRM5YHR070W 1500 nt10.7□□□□□ -0.7
RRP42Q12277 YFL067WYFL067W 528 nt10.69□□□□□ -0.7
RRP42Q12277 ATF2YGR177C 1608 nt10.68□□□□□ -0.7
RRP42Q12277 DDR2YOL052C-A 186 nt10.67□□□□□ -0.7
RRP42Q12277 YPR064WYPR064W 420 nt10.67□□□□□ -0.7
RRP42Q12277 LYS4YDR234W 2082 nt10.67□□□□□ -0.7
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