Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 ART5YGR068C 1761 nt11□□□□□ -0.65
TIR4Q12218 GUT2YIL155C 1950 nt10.98□□□□□ -0.65
TIR4Q12218 YGR021WYGR021W 873 nt10.98□□□□□ -0.65
TIR4Q12218 SEC11YIR022W 504 nt10.97□□□□□ -0.65
TIR4Q12218 HOM6YJR139C 1080 nt10.97□□□□□ -0.65
TIR4Q12218 SHU1YHL006C 453 nt10.95□□□□□ -0.66
TIR4Q12218 RTS2YOR077W 699 nt10.92□□□□□ -0.66
TIR4Q12218 PET9YBL030C 957 nt10.91□□□□□ -0.66
TIR4Q12218 PAC11YDR488C 1602 nt10.9□□□□□ -0.66
TIR4Q12218 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.89□□□□□ -0.67
TIR4Q12218 YSC84YHR016C 1407 nt10.88□□□□□ -0.67
TIR4Q12218 PIB2YGL023C 1908 nt10.86□□□□□ -0.67
TIR4Q12218 MNP1YGL068W 585 nt10.85□□□□□ -0.67
TIR4Q12218 TIR4YOR009W 1464 nt10.85□□□□□ -0.67
TIR4Q12218 YHL050CYHL050C 2094 nt10.85□□□□□ -0.67
TIR4Q12218 CUE1YMR264W 612 nt10.83□□□□□ -0.68
TIR4Q12218 YCH1YGR203W 447 nt10.81□□□□□ -0.68
TIR4Q12218 RKM5YLR137W 1104 nt10.8□□□□□ -0.68
TIR4Q12218 RRT12YCR045C 1476 nt10.76□□□□□ -0.69
TIR4Q12218 YMR057CYMR057C 372 nt10.73□□□□□ -0.69
TIR4Q12218 RTF1YGL244W 1677 nt10.71□□□□□ -0.69
TIR4Q12218 FPS1YLL043W 2010 nt10.71□□□□□ -0.69
TIR4Q12218 NPL3YDR432W 1245 nt10.68□□□□□ -0.7
TIR4Q12218 YIL100WYIL100W 354 nt10.64□□□□□ -0.71
TIR4Q12218 YNL195CYNL195C 786 nt10.63□□□□□ -0.71
TIR4Q12218 BOP3YNL042W 1191 nt10.61□□□□□ -0.71
TIR4Q12218 PTK1YKL198C 1989 nt10.59□□□□□ -0.71
TIR4Q12218 YKL097CYKL097C 411 nt10.58□□□□□ -0.72
TIR4Q12218 YLR236CYLR236C 324 nt10.57□□□□□ -0.72
TIR4Q12218 NCP1YHR042W 2076 nt10.55□□□□□ -0.72
TIR4Q12218 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.55□□□□□ -0.72
TIR4Q12218 YJL152WYJL152W 360 nt10.51□□□□□ -0.73
TIR4Q12218 NVJ2YPR091C 2313 nt10.51□□□□□ -0.73
TIR4Q12218 YOL037CYOL037C 354 nt10.47□□□□□ -0.73
TIR4Q12218 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.47□□□□□ -0.73
TIR4Q12218 LCB1YMR296C 1677 nt10.39□□□□□ -0.75
TIR4Q12218 RRD1YIL153W 1182 nt10.33□□□□□ -0.76
TIR4Q12218 YFL054CYFL054C 1941 nt10.31□□□□□ -0.76
TIR4Q12218 YOR139CYOR139C 393 nt10.31□□□□□ -0.76
TIR4Q12218 WHI5YOR083W 888 nt10.3□□□□□ -0.76
TIR4Q12218 SPT8YLR055C 1809 nt10.28□□□□□ -0.76
TIR4Q12218 YLR281CYLR281C 468 nt10.27□□□□□ -0.77
TIR4Q12218 YJL225CYJL225C 5277 nt10.27□□□□□ -0.77
TIR4Q12218 DED1YOR204W 1815 nt10.25□□□□□ -0.77
TIR4Q12218 FMP52YER004W 696 nt10.24□□□□□ -0.77
TIR4Q12218 IDH1YNL037C 1083 nt10.21□□□□□ -0.77
TIR4Q12218 PCM1YEL058W 1674 nt10.19□□□□□ -0.78
TIR4Q12218 FMT1YBL013W 1206 nt10.19□□□□□ -0.78
TIR4Q12218 GBP2YCL011C 1284 nt10.19□□□□□ -0.78
TIR4Q12218 LYS4YDR234W 2082 nt10.19□□□□□ -0.78
TIR4Q12218 SIM1YIL123W 1431 nt10.16□□□□□ -0.78
TIR4Q12218 TCD2YKL027W 1344 nt10.14□□□□□ -0.79
TIR4Q12218 SWE1YJL187C 2460 nt10.11□□□□□ -0.79
TIR4Q12218 ADH2YMR303C 1047 nt10.11□□□□□ -0.79
TIR4Q12218 BIO4YNR057C 714 nt10.11□□□□□ -0.79
TIR4Q12218 CWP1YKL096W 720 nt10.06□□□□□ -0.8
TIR4Q12218 BOR1YNL275W 1731 nt10.06□□□□□ -0.8
TIR4Q12218 SNF6YHL025W 999 nt10.05□□□□□ -0.8
TIR4Q12218 IMP2'YIL154C 1041 nt10.05□□□□□ -0.8
TIR4Q12218 SOR2YDL246C 1074 nt10.04□□□□□ -0.8
TIR4Q12218 SOR1YJR159W 1074 nt10.04□□□□□ -0.8
TIR4Q12218 DSK2YMR276W 1122 nt10.04□□□□□ -0.8
TIR4Q12218 YPR011CYPR011C 981 nt10.01□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 MXR2YCL033C 507 nt10.01□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 PUS2YGL063W 1113 nt10□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 FMP45YDL222C 930 nt9.99□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 YIH1YCR059C 777 nt9.98□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 CRR1YLR213C 1269 nt9.98□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 YDR433WYDR433W 441 nt9.97□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 ERF2YLR246W 1080 nt9.97□□□□□ -0.81
TIR4Q12218 HSP60YLR259C 1719 nt9.95□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.93□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 ERV46YAL042W 1248 nt9.93□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.92□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.92□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.92□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.92□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.92□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 FRD1YEL047C 1413 nt9.91□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 YLL053CYLL053C 459 nt9.91□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 LPX1YOR084W 1164 nt9.9□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 RNQ1YCL028W 1218 nt9.9□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 YCL042WYCL042W 360 nt9.9□□□□□ -0.82
TIR4Q12218 MIC10YCL057C-A 294 nt9.88□□□□□ -0.83
TIR4Q12218 ATF2YGR177C 1608 nt9.87□□□□□ -0.83
TIR4Q12218 UME6YDR207C 2511 nt9.86□□□□□ -0.83
TIR4Q12218 YKR040CYKR040C 504 nt9.86□□□□□ -0.83
TIR4Q12218 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.85□□□□□ -0.83
TIR4Q12218 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.85□□□□□ -0.83
TIR4Q12218 HEM12YDR047W 1089 nt9.84□□□□□ -0.83
TIR4Q12218 GLK1YCL040W 1503 nt9.83□□□□□ -0.84
TIR4Q12218 SNG1YGR197C 1644 nt9.82□□□□□ -0.84
TIR4Q12218 FUR4YBR021W 1902 nt9.82□□□□□ -0.84
TIR4Q12218 CCA1YER168C 1641 nt9.82□□□□□ -0.84
TIR4Q12218 FTR1YER145C 1215 nt9.81□□□□□ -0.84
TIR4Q12218 RAX1YOR301W 1308 nt9.79□□□□□ -0.84
TIR4Q12218 YFL067WYFL067W 528 nt9.78□□□□□ -0.84
TIR4Q12218 GAL1YBR020W 1587 nt9.77□□□□□ -0.85
TIR4Q12218 DIC1YLR348C 897 nt9.77□□□□□ -0.85
TIR4Q12218 TRM5YHR070W 1500 nt9.76□□□□□ -0.85
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