Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SIS1YNL007C 1059 nt12.93□□□□□ -0.34
VPS54Q12071 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.91□□□□□ -0.34
VPS54Q12071 RPP2AYOL039W 321 nt12.87□□□□□ -0.35
VPS54Q12071 PTP1YDL230W 1008 nt12.85□□□□□ -0.35
VPS54Q12071 DCW1YKL046C 1350 nt12.83□□□□□ -0.36
VPS54Q12071 YJL152WYJL152W 360 nt12.79□□□□□ -0.36
VPS54Q12071 TIR4YOR009W 1464 nt12.78□□□□□ -0.36
VPS54Q12071 ART5YGR068C 1761 nt12.76□□□□□ -0.37
VPS54Q12071 CAC2YML102W 1407 nt12.74□□□□□ -0.37
VPS54Q12071 YPR011CYPR011C 981 nt12.74□□□□□ -0.37
VPS54Q12071 SSA4YER103W 1929 nt12.73□□□□□ -0.37
VPS54Q12071 YCH1YGR203W 447 nt12.73□□□□□ -0.37
VPS54Q12071 YLR236CYLR236C 324 nt12.71□□□□□ -0.37
VPS54Q12071 DSK2YMR276W 1122 nt12.71□□□□□ -0.37
VPS54Q12071 GFD2YCL036W 1701 nt12.68□□□□□ -0.38
VPS54Q12071 EMI2YDR516C 1503 nt12.64□□□□□ -0.39
VPS54Q12071 IMP2'YIL154C 1041 nt12.64□□□□□ -0.39
VPS54Q12071 PET9YBL030C 957 nt12.64□□□□□ -0.39
VPS54Q12071 YMR057CYMR057C 372 nt12.63□□□□□ -0.39
VPS54Q12071 FMP45YDL222C 930 nt12.61□□□□□ -0.39
VPS54Q12071 YDL221WYDL221W 552 nt12.55□□□□□ -0.4
VPS54Q12071 IDH1YNL037C 1083 nt12.55□□□□□ -0.4
VPS54Q12071 IRC15YPL017C 1500 nt12.54□□□□□ -0.4
VPS54Q12071 RTS2YOR077W 699 nt12.54□□□□□ -0.4
VPS54Q12071 MOT3YMR070W 1473 nt12.53□□□□□ -0.4
VPS54Q12071 YMR090WYMR090W 684 nt12.49□□□□□ -0.41
VPS54Q12071 LPX1YOR084W 1164 nt12.49□□□□□ -0.41
VPS54Q12071 GBP2YCL011C 1284 nt12.48□□□□□ -0.41
VPS54Q12071 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.48□□□□□ -0.41
VPS54Q12071 YDR433WYDR433W 441 nt12.45□□□□□ -0.42
VPS54Q12071 FPS1YLL043W 2010 nt12.45□□□□□ -0.42
VPS54Q12071 ERV46YAL042W 1248 nt12.44□□□□□ -0.42
VPS54Q12071 GIS3YLR094C 1509 nt12.43□□□□□ -0.42
VPS54Q12071 MXR2YCL033C 507 nt12.39□□□□□ -0.43
VPS54Q12071 CUE1YMR264W 612 nt12.38□□□□□ -0.43
VPS54Q12071 SDH1YKL148C 1923 nt12.38□□□□□ -0.43
VPS54Q12071 YBR220CYBR220C 1683 nt12.37□□□□□ -0.43
VPS54Q12071 YKR040CYKR040C 504 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS54Q12071 SCC4YER147C 1875 nt12.33□□□□□ -0.44
VPS54Q12071 SPP1YPL138C 1062 nt12.31□□□□□ -0.44
VPS54Q12071 TCD2YKL027W 1344 nt12.31□□□□□ -0.44
VPS54Q12071 BDF1YLR399C 2061 nt12.3□□□□□ -0.44
VPS54Q12071 RRD1YIL153W 1182 nt12.29□□□□□ -0.44
VPS54Q12071 DED1YOR204W 1815 nt12.29□□□□□ -0.44
VPS54Q12071 PAC11YDR488C 1602 nt12.24□□□□□ -0.45
VPS54Q12071 YIL100WYIL100W 354 nt12.21□□□□□ -0.45
VPS54Q12071 FMT1YBL013W 1206 nt12.18□□□□□ -0.46
VPS54Q12071 FRD1YEL047C 1413 nt12.14□□□□□ -0.47
VPS54Q12071 TAT1YBR069C 1860 nt12.12□□□□□ -0.47
VPS54Q12071 Q0182Q0182 405 nt12.11□□□□□ -0.47
VPS54Q12071 SOR2YDL246C 1074 nt12.06□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 FMP52YER004W 696 nt12.06□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 SOR1YJR159W 1074 nt12.06□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 YCL042WYCL042W 360 nt12.06□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 RTG1YOL067C 534 nt12.05□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 RRT12YCR045C 1476 nt12.05□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 CWP1YKL096W 720 nt12.03□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 YSC84YHR016C 1407 nt12.03□□□□□ -0.48
VPS54Q12071 ADH2YMR303C 1047 nt12.01□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 MRPL8YJL063C 717 nt12□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 YNL195CYNL195C 786 nt12□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 YHL050CYHL050C 2094 nt11.98□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.97□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 YEL076CYEL076C 651 nt11.97□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 PTH1YHR189W 573 nt11.97□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 YLR464WYLR464W 651 nt11.97□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 NVJ2YPR091C 2313 nt11.97□□□□□ -0.49
VPS54Q12071 PCM1YEL058W 1674 nt11.95□□□□□ -0.5
VPS54Q12071 ADO1YJR105W 1023 nt11.89□□□□□ -0.51
VPS54Q12071 SNF6YHL025W 999 nt11.88□□□□□ -0.51
VPS54Q12071 SEC11YIR022W 504 nt11.86□□□□□ -0.51
VPS54Q12071 YLR235CYLR235C 399 nt11.86□□□□□ -0.51
VPS54Q12071 YKL030WYKL030W 606 nt11.82□□□□□ -0.52
VPS54Q12071 LCB1YMR296C 1677 nt11.81□□□□□ -0.52
VPS54Q12071 PCH2YBR186W 1695 nt11.8□□□□□ -0.52
VPS54Q12071 DIC1YLR348C 897 nt11.79□□□□□ -0.52
VPS54Q12071 HUA1YGR268C 597 nt11.78□□□□□ -0.52
VPS54Q12071 YIH1YCR059C 777 nt11.76□□□□□ -0.53
VPS54Q12071 RNQ1YCL028W 1218 nt11.76□□□□□ -0.53
VPS54Q12071 SIM1YIL123W 1431 nt11.74□□□□□ -0.53
VPS54Q12071 GUT2YIL155C 1950 nt11.73□□□□□ -0.53
VPS54Q12071 TIM23YNR017W 669 nt11.73□□□□□ -0.53
VPS54Q12071 BIO4YNR057C 714 nt11.73□□□□□ -0.53
VPS54Q12071 YLL053CYLL053C 459 nt11.69□□□□□ -0.54
VPS54Q12071 YLR179CYLR179C 606 nt11.67□□□□□ -0.54
VPS54Q12071 NCP1YHR042W 2076 nt11.64□□□□□ -0.55
VPS54Q12071 UBX6YJL048C 1191 nt11.62□□□□□ -0.55
VPS54Q12071 PIB2YGL023C 1908 nt11.6□□□□□ -0.55
VPS54Q12071 FTR1YER145C 1215 nt11.59□□□□□ -0.55
VPS54Q12071 WSC2YNL283C 1512 nt11.58□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 GAL1YBR020W 1587 nt11.58□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 RTF1YGL244W 1677 nt11.57□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 AHT1YHR093W 549 nt11.55□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 BOP3YNL042W 1191 nt11.55□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 YPR064WYPR064W 420 nt11.55□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 TRM5YHR070W 1500 nt11.55□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 ATF2YGR177C 1608 nt11.53□□□□□ -0.56
VPS54Q12071 YDR094WYDR094W 336 nt11.51□□□□□ -0.57
VPS54Q12071 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.51□□□□□ -0.57
VPS54Q12071 ERF2YLR246W 1080 nt11.5□□□□□ -0.57
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