Protein–RNA interactions for Protein: Q12059

ULA1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ULA1Q12059 HOM6YJR139C 1080 nt11.85□□□□□ -0.51
ULA1Q12059 GFD2YCL036W 1701 nt11.85□□□□□ -0.51
ULA1Q12059 ART5YGR068C 1761 nt11.84□□□□□ -0.51
ULA1Q12059 SEC11YIR022W 504 nt11.83□□□□□ -0.52
ULA1Q12059 PCH2YBR186W 1695 nt11.81□□□□□ -0.52
ULA1Q12059 Q0182Q0182 405 nt11.8□□□□□ -0.52
ULA1Q12059 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.77□□□□□ -0.53
ULA1Q12059 PET9YBL030C 957 nt11.77□□□□□ -0.53
ULA1Q12059 GUT2YIL155C 1950 nt11.76□□□□□ -0.53
ULA1Q12059 RTS2YOR077W 699 nt11.74□□□□□ -0.53
ULA1Q12059 MNP1YGL068W 585 nt11.7□□□□□ -0.54
ULA1Q12059 YCH1YGR203W 447 nt11.7□□□□□ -0.54
ULA1Q12059 YSC84YHR016C 1407 nt11.69□□□□□ -0.54
ULA1Q12059 RKM5YLR137W 1104 nt11.68□□□□□ -0.54
ULA1Q12059 CUE1YMR264W 612 nt11.67□□□□□ -0.54
ULA1Q12059 TIR4YOR009W 1464 nt11.66□□□□□ -0.54
ULA1Q12059 PAC11YDR488C 1602 nt11.65□□□□□ -0.54
ULA1Q12059 YHL050CYHL050C 2094 nt11.63□□□□□ -0.55
ULA1Q12059 YKL097CYKL097C 411 nt11.62□□□□□ -0.55
ULA1Q12059 PIB2YGL023C 1908 nt11.59□□□□□ -0.55
ULA1Q12059 YMR057CYMR057C 372 nt11.56□□□□□ -0.56
ULA1Q12059 RRT12YCR045C 1476 nt11.54□□□□□ -0.56
ULA1Q12059 NVJ2YPR091C 2313 nt11.52□□□□□ -0.57
ULA1Q12059 YIL100WYIL100W 354 nt11.52□□□□□ -0.57
ULA1Q12059 YNL195CYNL195C 786 nt11.52□□□□□ -0.57
ULA1Q12059 FPS1YLL043W 2010 nt11.52□□□□□ -0.57
ULA1Q12059 RTF1YGL244W 1677 nt11.5□□□□□ -0.57
ULA1Q12059 NPL3YDR432W 1245 nt11.5□□□□□ -0.57
ULA1Q12059 YJL225CYJL225C 5277 nt11.47□□□□□ -0.57
ULA1Q12059 YLR236CYLR236C 324 nt11.45□□□□□ -0.58
ULA1Q12059 BOP3YNL042W 1191 nt11.43□□□□□ -0.58
ULA1Q12059 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.41□□□□□ -0.58
ULA1Q12059 YJL152WYJL152W 360 nt11.39□□□□□ -0.59
ULA1Q12059 YOL037CYOL037C 354 nt11.38□□□□□ -0.59
ULA1Q12059 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.35□□□□□ -0.59
ULA1Q12059 PTK1YKL198C 1989 nt11.34□□□□□ -0.59
ULA1Q12059 NCP1YHR042W 2076 nt11.31□□□□□ -0.6
ULA1Q12059 WHI5YOR083W 888 nt11.15□□□□□ -0.62
ULA1Q12059 LCB1YMR296C 1677 nt11.14□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 YOR139CYOR139C 393 nt11.14□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 YLR281CYLR281C 468 nt11.12□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 RRD1YIL153W 1182 nt11.11□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.11□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.11□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 IDH1YNL037C 1083 nt11.09□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 YFL054CYFL054C 1941 nt11.09□□□□□ -0.63
ULA1Q12059 FMP52YER004W 696 nt11.07□□□□□ -0.64
ULA1Q12059 SPT8YLR055C 1809 nt11.05□□□□□ -0.64
ULA1Q12059 GBP2YCL011C 1284 nt11.04□□□□□ -0.64
ULA1Q12059 DED1YOR204W 1815 nt11.02□□□□□ -0.65
ULA1Q12059 TCD2YKL027W 1344 nt11.01□□□□□ -0.65
ULA1Q12059 PCM1YEL058W 1674 nt10.99□□□□□ -0.65
ULA1Q12059 MOT3YMR070W 1473 nt10.99□□□□□ -0.65
ULA1Q12059 SIM1YIL123W 1431 nt10.97□□□□□ -0.65
ULA1Q12059 IMP2'YIL154C 1041 nt10.95□□□□□ -0.66
ULA1Q12059 FMT1YBL013W 1206 nt10.94□□□□□ -0.66
ULA1Q12059 LYS4YDR234W 2082 nt10.94□□□□□ -0.66
ULA1Q12059 DSK2YMR276W 1122 nt10.88□□□□□ -0.67
ULA1Q12059 ADH2YMR303C 1047 nt10.88□□□□□ -0.67
ULA1Q12059 BIO4YNR057C 714 nt10.88□□□□□ -0.67
ULA1Q12059 SNF6YHL025W 999 nt10.87□□□□□ -0.67
ULA1Q12059 CWP1YKL096W 720 nt10.86□□□□□ -0.67
ULA1Q12059 PUS2YGL063W 1113 nt10.85□□□□□ -0.67
ULA1Q12059 SWE1YJL187C 2460 nt10.84□□□□□ -0.67
ULA1Q12059 SOR2YDL246C 1074 nt10.83□□□□□ -0.68
ULA1Q12059 SOR1YJR159W 1074 nt10.83□□□□□ -0.68
ULA1Q12059 BOR1YNL275W 1731 nt10.83□□□□□ -0.68
ULA1Q12059 YDR433WYDR433W 441 nt10.82□□□□□ -0.68
ULA1Q12059 FMP45YDL222C 930 nt10.79□□□□□ -0.68
ULA1Q12059 MXR2YCL033C 507 nt10.79□□□□□ -0.68
ULA1Q12059 ERF2YLR246W 1080 nt10.77□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 YCL042WYCL042W 360 nt10.76□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.75□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.75□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.75□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.75□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.75□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 YPR011CYPR011C 981 nt10.75□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 YIH1YCR059C 777 nt10.74□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 CRR1YLR213C 1269 nt10.74□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 ERV46YAL042W 1248 nt10.73□□□□□ -0.69
ULA1Q12059 RNQ1YCL028W 1218 nt10.69□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 YKR040CYKR040C 504 nt10.68□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 FRD1YEL047C 1413 nt10.67□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 YLL053CYLL053C 459 nt10.67□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 LPX1YOR084W 1164 nt10.67□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.66□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 UME6YDR207C 2511 nt10.66□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 HSP60YLR259C 1719 nt10.66□□□□□ -0.7
ULA1Q12059 HEM12YDR047W 1089 nt10.63□□□□□ -0.71
ULA1Q12059 ATF2YGR177C 1608 nt10.62□□□□□ -0.71
ULA1Q12059 YFL067WYFL067W 528 nt10.59□□□□□ -0.71
ULA1Q12059 MIC10YCL057C-A 294 nt10.59□□□□□ -0.71
ULA1Q12059 FTR1YER145C 1215 nt10.58□□□□□ -0.72
ULA1Q12059 SNG1YGR197C 1644 nt10.58□□□□□ -0.72
ULA1Q12059 GLK1YCL040W 1503 nt10.57□□□□□ -0.72
ULA1Q12059 RAX1YOR301W 1308 nt10.56□□□□□ -0.72
ULA1Q12059 DIC1YLR348C 897 nt10.55□□□□□ -0.72
ULA1Q12059 GAL1YBR020W 1587 nt10.54□□□□□ -0.72
ULA1Q12059 FUR4YBR021W 1902 nt10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms