Protein–RNA interactions for Protein: Q12039

HMI1, ATP-dependent DNA helicase HMI1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMI1Q12039 SDH1YKL148C 1923 nt13.41□□□□□ -0.26
HMI1Q12039 TAT1YBR069C 1860 nt13.4□□□□□ -0.26
HMI1Q12039 ART5YGR068C 1761 nt13.39□□□□□ -0.27
HMI1Q12039 IRC15YPL017C 1500 nt13.39□□□□□ -0.27
HMI1Q12039 YOR139CYOR139C 393 nt13.38□□□□□ -0.27
HMI1Q12039 GFD2YCL036W 1701 nt13.36□□□□□ -0.27
HMI1Q12039 GIS3YLR094C 1509 nt13.3□□□□□ -0.28
HMI1Q12039 SCC4YER147C 1875 nt13.3□□□□□ -0.28
HMI1Q12039 RTS2YOR077W 699 nt13.3□□□□□ -0.28
HMI1Q12039 NPL3YDR432W 1245 nt13.27□□□□□ -0.29
HMI1Q12039 TIR4YOR009W 1464 nt13.26□□□□□ -0.29
HMI1Q12039 PET9YBL030C 957 nt13.25□□□□□ -0.29
HMI1Q12039 YCH1YGR203W 447 nt13.16□□□□□ -0.3
HMI1Q12039 YMR057CYMR057C 372 nt13.15□□□□□ -0.3
HMI1Q12039 YOL037CYOL037C 354 nt13.14□□□□□ -0.31
HMI1Q12039 CUE1YMR264W 612 nt13.1□□□□□ -0.31
HMI1Q12039 YJL152WYJL152W 360 nt13.08□□□□□ -0.32
HMI1Q12039 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.08□□□□□ -0.32
HMI1Q12039 YSC84YHR016C 1407 nt13.04□□□□□ -0.32
HMI1Q12039 PCH2YBR186W 1695 nt13.02□□□□□ -0.32
HMI1Q12039 FPS1YLL043W 2010 nt13.01□□□□□ -0.33
HMI1Q12039 SEC11YIR022W 504 nt13.01□□□□□ -0.33
HMI1Q12039 GUT2YIL155C 1950 nt12.97□□□□□ -0.33
HMI1Q12039 YHL050CYHL050C 2094 nt12.95□□□□□ -0.34
HMI1Q12039 YIL100WYIL100W 354 nt12.95□□□□□ -0.34
HMI1Q12039 RRT12YCR045C 1476 nt12.95□□□□□ -0.34
HMI1Q12039 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.91□□□□□ -0.34
HMI1Q12039 YLR236CYLR236C 324 nt12.9□□□□□ -0.34
HMI1Q12039 WHI5YOR083W 888 nt12.9□□□□□ -0.34
HMI1Q12039 YLR281CYLR281C 468 nt12.87□□□□□ -0.35
HMI1Q12039 YNL195CYNL195C 786 nt12.87□□□□□ -0.35
HMI1Q12039 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.86□□□□□ -0.35
HMI1Q12039 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.86□□□□□ -0.35
HMI1Q12039 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.86□□□□□ -0.35
HMI1Q12039 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.86□□□□□ -0.35
HMI1Q12039 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.86□□□□□ -0.35
HMI1Q12039 PIB2YGL023C 1908 nt12.78□□□□□ -0.36
HMI1Q12039 PUS2YGL063W 1113 nt12.74□□□□□ -0.37
HMI1Q12039 RTF1YGL244W 1677 nt12.71□□□□□ -0.37
HMI1Q12039 IDH1YNL037C 1083 nt12.71□□□□□ -0.37
HMI1Q12039 GBP2YCL011C 1284 nt12.68□□□□□ -0.38
HMI1Q12039 RRD1YIL153W 1182 nt12.65□□□□□ -0.38
HMI1Q12039 PAC11YDR488C 1602 nt12.65□□□□□ -0.38
HMI1Q12039 NVJ2YPR091C 2313 nt12.64□□□□□ -0.39
HMI1Q12039 BOP3YNL042W 1191 nt12.64□□□□□ -0.39
HMI1Q12039 DSK2YMR276W 1122 nt12.59□□□□□ -0.39
HMI1Q12039 DED1YOR204W 1815 nt12.58□□□□□ -0.4
HMI1Q12039 TCD2YKL027W 1344 nt12.56□□□□□ -0.4
HMI1Q12039 IMP2'YIL154C 1041 nt12.55□□□□□ -0.4
HMI1Q12039 YPR011CYPR011C 981 nt12.55□□□□□ -0.4
HMI1Q12039 NCP1YHR042W 2076 nt12.55□□□□□ -0.4
HMI1Q12039 PTK1YKL198C 1989 nt12.52□□□□□ -0.4
HMI1Q12039 YDR433WYDR433W 441 nt12.51□□□□□ -0.41
HMI1Q12039 LCB1YMR296C 1677 nt12.51□□□□□ -0.41
HMI1Q12039 FMT1YBL013W 1206 nt12.5□□□□□ -0.41
HMI1Q12039 MXR2YCL033C 507 nt12.49□□□□□ -0.41
HMI1Q12039 FMP52YER004W 696 nt12.48□□□□□ -0.41
HMI1Q12039 FMP45YDL222C 930 nt12.46□□□□□ -0.41
HMI1Q12039 PCM1YEL058W 1674 nt12.45□□□□□ -0.42
HMI1Q12039 MOT3YMR070W 1473 nt12.41□□□□□ -0.42
HMI1Q12039 CWP1YKL096W 720 nt12.41□□□□□ -0.42
HMI1Q12039 ADH2YMR303C 1047 nt12.41□□□□□ -0.42
HMI1Q12039 LPX1YOR084W 1164 nt12.4□□□□□ -0.42
HMI1Q12039 SIM1YIL123W 1431 nt12.38□□□□□ -0.43
HMI1Q12039 ERV46YAL042W 1248 nt12.35□□□□□ -0.43
HMI1Q12039 SNF6YHL025W 999 nt12.34□□□□□ -0.43
HMI1Q12039 YFL054CYFL054C 1941 nt12.31□□□□□ -0.44
HMI1Q12039 SOR2YDL246C 1074 nt12.31□□□□□ -0.44
HMI1Q12039 SOR1YJR159W 1074 nt12.31□□□□□ -0.44
HMI1Q12039 YKR040CYKR040C 504 nt12.3□□□□□ -0.44
HMI1Q12039 BIO4YNR057C 714 nt12.3□□□□□ -0.44
HMI1Q12039 YCL042WYCL042W 360 nt12.3□□□□□ -0.44
HMI1Q12039 FRD1YEL047C 1413 nt12.26□□□□□ -0.45
HMI1Q12039 LYS4YDR234W 2082 nt12.22□□□□□ -0.45
HMI1Q12039 SPT8YLR055C 1809 nt12.19□□□□□ -0.46
HMI1Q12039 YIH1YCR059C 777 nt12.16□□□□□ -0.46
HMI1Q12039 YLL053CYLL053C 459 nt12.12□□□□□ -0.47
HMI1Q12039 RNQ1YCL028W 1218 nt12.12□□□□□ -0.47
HMI1Q12039 ERF2YLR246W 1080 nt12.1□□□□□ -0.47
HMI1Q12039 CRR1YLR213C 1269 nt12.08□□□□□ -0.48
HMI1Q12039 DIC1YLR348C 897 nt12.06□□□□□ -0.48
HMI1Q12039 SPP1YPL138C 1062 nt12.06□□□□□ -0.48
HMI1Q12039 ATF2YGR177C 1608 nt12.03□□□□□ -0.48
HMI1Q12039 SWE1YJL187C 2460 nt12.02□□□□□ -0.48
HMI1Q12039 FTR1YER145C 1215 nt12□□□□□ -0.49
HMI1Q12039 PTH1YHR189W 573 nt12□□□□□ -0.49
HMI1Q12039 MIC10YCL057C-A 294 nt11.99□□□□□ -0.49
HMI1Q12039 MRPL8YJL063C 717 nt11.98□□□□□ -0.49
HMI1Q12039 GAL1YBR020W 1587 nt11.97□□□□□ -0.49
HMI1Q12039 HEM12YDR047W 1089 nt11.97□□□□□ -0.49
HMI1Q12039 TRM5YHR070W 1500 nt11.96□□□□□ -0.49
HMI1Q12039 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.95□□□□□ -0.5
HMI1Q12039 SNG1YGR197C 1644 nt11.94□□□□□ -0.5
HMI1Q12039 YFL067WYFL067W 528 nt11.93□□□□□ -0.5
HMI1Q12039 DDR2YOL052C-A 186 nt11.9□□□□□ -0.5
HMI1Q12039 YLR235CYLR235C 399 nt11.88□□□□□ -0.51
HMI1Q12039 RTG1YOL067C 534 nt11.87□□□□□ -0.51
HMI1Q12039 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.86□□□□□ -0.51
HMI1Q12039 YEL076CYEL076C 651 nt11.86□□□□□ -0.51
HMI1Q12039 ADO1YJR105W 1023 nt11.86□□□□□ -0.51
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