Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 WHI5YOR083W 888 nt14.48□□□□□ -0.09
RIM20Q12033 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.47□□□□□ -0.09
RIM20Q12033 ART5YGR068C 1761 nt14.47□□□□□ -0.09
RIM20Q12033 TIR4YOR009W 1464 nt14.45□□□□□ -0.1
RIM20Q12033 GFD2YCL036W 1701 nt14.41□□□□□ -0.1
RIM20Q12033 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.4□□□□□ -0.1
RIM20Q12033 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.4□□□□□ -0.1
RIM20Q12033 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.4□□□□□ -0.1
RIM20Q12033 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.4□□□□□ -0.1
RIM20Q12033 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.4□□□□□ -0.1
RIM20Q12033 YDL221WYDL221W 552 nt14.37□□□□□ -0.11
RIM20Q12033 YJL152WYJL152W 360 nt14.37□□□□□ -0.11
RIM20Q12033 PUS2YGL063W 1113 nt14.34□□□□□ -0.11
RIM20Q12033 YCH1YGR203W 447 nt14.34□□□□□ -0.11
RIM20Q12033 PET9YBL030C 957 nt14.33□□□□□ -0.12
RIM20Q12033 IRC15YPL017C 1500 nt14.31□□□□□ -0.12
RIM20Q12033 YMR090WYMR090W 684 nt14.3□□□□□ -0.12
RIM20Q12033 YMR057CYMR057C 372 nt14.29□□□□□ -0.12
RIM20Q12033 RTS2YOR077W 699 nt14.28□□□□□ -0.12
RIM20Q12033 YBR220CYBR220C 1683 nt14.23□□□□□ -0.13
RIM20Q12033 GIS3YLR094C 1509 nt14.21□□□□□ -0.13
RIM20Q12033 SDH1YKL148C 1923 nt14.2□□□□□ -0.14
RIM20Q12033 YPR011CYPR011C 981 nt14.18□□□□□ -0.14
RIM20Q12033 YLR236CYLR236C 324 nt14.16□□□□□ -0.14
RIM20Q12033 DSK2YMR276W 1122 nt14.14□□□□□ -0.15
RIM20Q12033 SCC4YER147C 1875 nt14.12□□□□□ -0.15
RIM20Q12033 FPS1YLL043W 2010 nt14.11□□□□□ -0.15
RIM20Q12033 CUE1YMR264W 612 nt14.08□□□□□ -0.16
RIM20Q12033 BDF1YLR399C 2061 nt14.07□□□□□ -0.16
RIM20Q12033 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.07□□□□□ -0.16
RIM20Q12033 IDH1YNL037C 1083 nt14.06□□□□□ -0.16
RIM20Q12033 IMP2'YIL154C 1041 nt14.05□□□□□ -0.16
RIM20Q12033 FMP45YDL222C 930 nt13.98□□□□□ -0.17
RIM20Q12033 GBP2YCL011C 1284 nt13.98□□□□□ -0.17
RIM20Q12033 LPX1YOR084W 1164 nt13.93□□□□□ -0.18
RIM20Q12033 YDR433WYDR433W 441 nt13.91□□□□□ -0.18
RIM20Q12033 YIL100WYIL100W 354 nt13.89□□□□□ -0.19
RIM20Q12033 TAT1YBR069C 1860 nt13.89□□□□□ -0.19
RIM20Q12033 MXR2YCL033C 507 nt13.88□□□□□ -0.19
RIM20Q12033 RRD1YIL153W 1182 nt13.87□□□□□ -0.19
RIM20Q12033 ERV46YAL042W 1248 nt13.86□□□□□ -0.19
RIM20Q12033 DED1YOR204W 1815 nt13.85□□□□□ -0.19
RIM20Q12033 TCD2YKL027W 1344 nt13.82□□□□□ -0.2
RIM20Q12033 YSC84YHR016C 1407 nt13.79□□□□□ -0.2
RIM20Q12033 RRT12YCR045C 1476 nt13.79□□□□□ -0.2
RIM20Q12033 MOT3YMR070W 1473 nt13.79□□□□□ -0.2
RIM20Q12033 YKR040CYKR040C 504 nt13.75□□□□□ -0.21
RIM20Q12033 YHL050CYHL050C 2094 nt13.75□□□□□ -0.21
RIM20Q12033 FMT1YBL013W 1206 nt13.73□□□□□ -0.21
RIM20Q12033 YNL195CYNL195C 786 nt13.69□□□□□ -0.22
RIM20Q12033 SPP1YPL138C 1062 nt13.67□□□□□ -0.22
RIM20Q12033 SEC11YIR022W 504 nt13.64□□□□□ -0.23
RIM20Q12033 PCH2YBR186W 1695 nt13.62□□□□□ -0.23
RIM20Q12033 FRD1YEL047C 1413 nt13.6□□□□□ -0.23
RIM20Q12033 FMP52YER004W 696 nt13.6□□□□□ -0.23
RIM20Q12033 CWP1YKL096W 720 nt13.56□□□□□ -0.24
RIM20Q12033 ADH2YMR303C 1047 nt13.56□□□□□ -0.24
RIM20Q12033 GUT2YIL155C 1950 nt13.55□□□□□ -0.24
RIM20Q12033 SOR2YDL246C 1074 nt13.55□□□□□ -0.24
RIM20Q12033 SOR1YJR159W 1074 nt13.55□□□□□ -0.24
RIM20Q12033 YCL042WYCL042W 360 nt13.54□□□□□ -0.24
RIM20Q12033 PCM1YEL058W 1674 nt13.52□□□□□ -0.25
RIM20Q12033 SNF6YHL025W 999 nt13.42□□□□□ -0.26
RIM20Q12033 PIB2YGL023C 1908 nt13.4□□□□□ -0.26
RIM20Q12033 PTH1YHR189W 573 nt13.39□□□□□ -0.27
RIM20Q12033 LCB1YMR296C 1677 nt13.39□□□□□ -0.27
RIM20Q12033 NCP1YHR042W 2076 nt13.34□□□□□ -0.27
RIM20Q12033 SIM1YIL123W 1431 nt13.33□□□□□ -0.28
RIM20Q12033 RTF1YGL244W 1677 nt13.33□□□□□ -0.28
RIM20Q12033 RTG1YOL067C 534 nt13.31□□□□□ -0.28
RIM20Q12033 BIO4YNR057C 714 nt13.3□□□□□ -0.28
RIM20Q12033 YIH1YCR059C 777 nt13.28□□□□□ -0.28
RIM20Q12033 BOP3YNL042W 1191 nt13.28□□□□□ -0.28
RIM20Q12033 DIC1YLR348C 897 nt13.25□□□□□ -0.29
RIM20Q12033 RNQ1YCL028W 1218 nt13.25□□□□□ -0.29
RIM20Q12033 YLR235CYLR235C 399 nt13.23□□□□□ -0.29
RIM20Q12033 YLL053CYLL053C 459 nt13.21□□□□□ -0.29
RIM20Q12033 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.18□□□□□ -0.3
RIM20Q12033 YEL076CYEL076C 651 nt13.18□□□□□ -0.3
RIM20Q12033 YLR464WYLR464W 651 nt13.18□□□□□ -0.3
RIM20Q12033 PTK1YKL198C 1989 nt13.17□□□□□ -0.3
RIM20Q12033 YKL030WYKL030W 606 nt13.16□□□□□ -0.3
RIM20Q12033 MRPL8YJL063C 717 nt13.14□□□□□ -0.31
RIM20Q12033 TIM23YNR017W 669 nt13.14□□□□□ -0.31
RIM20Q12033 LYS4YDR234W 2082 nt13.1□□□□□ -0.31
RIM20Q12033 FTR1YER145C 1215 nt13.09□□□□□ -0.31
RIM20Q12033 YLR179CYLR179C 606 nt13.08□□□□□ -0.32
RIM20Q12033 GAL1YBR020W 1587 nt13.07□□□□□ -0.32
RIM20Q12033 ERF2YLR246W 1080 nt13.05□□□□□ -0.32
RIM20Q12033 ATF2YGR177C 1608 nt13.05□□□□□ -0.32
RIM20Q12033 TRM5YHR070W 1500 nt13.04□□□□□ -0.32
RIM20Q12033 CRR1YLR213C 1269 nt13.03□□□□□ -0.32
RIM20Q12033 ADO1YJR105W 1023 nt13.02□□□□□ -0.33
RIM20Q12033 HUA1YGR268C 597 nt13□□□□□ -0.33
RIM20Q12033 WSC2YNL283C 1512 nt12.99□□□□□ -0.33
RIM20Q12033 YFL067WYFL067W 528 nt12.94□□□□□ -0.34
RIM20Q12033 AHT1YHR093W 549 nt12.94□□□□□ -0.34
RIM20Q12033 MIC10YCL057C-A 294 nt12.94□□□□□ -0.34
RIM20Q12033 DDR2YOL052C-A 186 nt12.93□□□□□ -0.34
RIM20Q12033 AQY1YPR192W 918 nt12.93□□□□□ -0.34
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