Protein–RNA interactions for Protein: Q12028

APL4, AP-1 complex subunit gamma-1, yeastyeast

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL4Q12028 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.49□□□□□ -0.25
APL4Q12028 ART5YGR068C 1761 nt13.48□□□□□ -0.25
APL4Q12028 GFD2YCL036W 1701 nt13.47□□□□□ -0.25
APL4Q12028 GIS3YLR094C 1509 nt13.46□□□□□ -0.25
APL4Q12028 SCC4YER147C 1875 nt13.46□□□□□ -0.26
APL4Q12028 RTS2YOR077W 699 nt13.39□□□□□ -0.27
APL4Q12028 RKM5YLR137W 1104 nt13.38□□□□□ -0.27
APL4Q12028 TIR4YOR009W 1464 nt13.33□□□□□ -0.28
APL4Q12028 PET9YBL030C 957 nt13.3□□□□□ -0.28
APL4Q12028 YKL097CYKL097C 411 nt13.29□□□□□ -0.28
APL4Q12028 PCH2YBR186W 1695 nt13.27□□□□□ -0.29
APL4Q12028 GUT2YIL155C 1950 nt13.23□□□□□ -0.29
APL4Q12028 YSC84YHR016C 1407 nt13.22□□□□□ -0.29
APL4Q12028 YMR057CYMR057C 372 nt13.2□□□□□ -0.3
APL4Q12028 CUE1YMR264W 612 nt13.19□□□□□ -0.3
APL4Q12028 SEC11YIR022W 504 nt13.18□□□□□ -0.3
APL4Q12028 YHL050CYHL050C 2094 nt13.17□□□□□ -0.3
APL4Q12028 NPL3YDR432W 1245 nt13.17□□□□□ -0.3
APL4Q12028 YCH1YGR203W 447 nt13.17□□□□□ -0.3
APL4Q12028 RRT12YCR045C 1476 nt13.13□□□□□ -0.31
APL4Q12028 FPS1YLL043W 2010 nt13.13□□□□□ -0.31
APL4Q12028 PIB2YGL023C 1908 nt13.12□□□□□ -0.31
APL4Q12028 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.03□□□□□ -0.32
APL4Q12028 YJL152WYJL152W 360 nt12.99□□□□□ -0.33
APL4Q12028 YOL037CYOL037C 354 nt12.99□□□□□ -0.33
APL4Q12028 YIL100WYIL100W 354 nt12.96□□□□□ -0.33
APL4Q12028 YOR139CYOR139C 393 nt12.96□□□□□ -0.33
APL4Q12028 PAC11YDR488C 1602 nt12.95□□□□□ -0.34
APL4Q12028 RTF1YGL244W 1677 nt12.92□□□□□ -0.34
APL4Q12028 YLR236CYLR236C 324 nt12.9□□□□□ -0.34
APL4Q12028 YNL195CYNL195C 786 nt12.89□□□□□ -0.35
APL4Q12028 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.85□□□□□ -0.35
APL4Q12028 WHI5YOR083W 888 nt12.81□□□□□ -0.36
APL4Q12028 PTK1YKL198C 1989 nt12.81□□□□□ -0.36
APL4Q12028 BOP3YNL042W 1191 nt12.8□□□□□ -0.36
APL4Q12028 NCP1YHR042W 2076 nt12.8□□□□□ -0.36
APL4Q12028 YLR281CYLR281C 468 nt12.79□□□□□ -0.36
APL4Q12028 RRD1YIL153W 1182 nt12.72□□□□□ -0.37
APL4Q12028 LCB1YMR296C 1677 nt12.67□□□□□ -0.38
APL4Q12028 DED1YOR204W 1815 nt12.65□□□□□ -0.38
APL4Q12028 Q0182Q0182 405 nt12.64□□□□□ -0.39
APL4Q12028 GBP2YCL011C 1284 nt12.61□□□□□ -0.39
APL4Q12028 IDH1YNL037C 1083 nt12.6□□□□□ -0.39
APL4Q12028 FMT1YBL013W 1206 nt12.59□□□□□ -0.39
APL4Q12028 YPR011CYPR011C 981 nt12.56□□□□□ -0.4
APL4Q12028 PUS2YGL063W 1113 nt12.51□□□□□ -0.41
APL4Q12028 FMP52YER004W 696 nt12.5□□□□□ -0.41
APL4Q12028 TCD2YKL027W 1344 nt12.5□□□□□ -0.41
APL4Q12028 PCM1YEL058W 1674 nt12.5□□□□□ -0.41
APL4Q12028 YFL054CYFL054C 1941 nt12.48□□□□□ -0.41
APL4Q12028 DSK2YMR276W 1122 nt12.47□□□□□ -0.41
APL4Q12028 MXR2YCL033C 507 nt12.47□□□□□ -0.41
APL4Q12028 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.46□□□□□ -0.41
APL4Q12028 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.46□□□□□ -0.41
APL4Q12028 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.46□□□□□ -0.41
APL4Q12028 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.46□□□□□ -0.41
APL4Q12028 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.46□□□□□ -0.41
APL4Q12028 ADH2YMR303C 1047 nt12.45□□□□□ -0.42
APL4Q12028 NVJ2YPR091C 2313 nt12.44□□□□□ -0.42
APL4Q12028 SIM1YIL123W 1431 nt12.43□□□□□ -0.42
APL4Q12028 FMP45YDL222C 930 nt12.42□□□□□ -0.42
APL4Q12028 LYS4YDR234W 2082 nt12.42□□□□□ -0.42
APL4Q12028 CWP1YKL096W 720 nt12.41□□□□□ -0.42
APL4Q12028 SPT8YLR055C 1809 nt12.41□□□□□ -0.42
APL4Q12028 YDR433WYDR433W 441 nt12.4□□□□□ -0.42
APL4Q12028 IMP2'YIL154C 1041 nt12.4□□□□□ -0.42
APL4Q12028 BIO4YNR057C 714 nt12.38□□□□□ -0.43
APL4Q12028 LPX1YOR084W 1164 nt12.35□□□□□ -0.43
APL4Q12028 SOR2YDL246C 1074 nt12.33□□□□□ -0.44
APL4Q12028 SNF6YHL025W 999 nt12.33□□□□□ -0.44
APL4Q12028 SOR1YJR159W 1074 nt12.33□□□□□ -0.44
APL4Q12028 ERV46YAL042W 1248 nt12.3□□□□□ -0.44
APL4Q12028 FRD1YEL047C 1413 nt12.27□□□□□ -0.45
APL4Q12028 YKR040CYKR040C 504 nt12.23□□□□□ -0.45
APL4Q12028 SWE1YJL187C 2460 nt12.23□□□□□ -0.45
APL4Q12028 YIH1YCR059C 777 nt12.22□□□□□ -0.45
APL4Q12028 YCL042WYCL042W 360 nt12.21□□□□□ -0.45
APL4Q12028 CRR1YLR213C 1269 nt12.18□□□□□ -0.46
APL4Q12028 YLL053CYLL053C 459 nt12.17□□□□□ -0.46
APL4Q12028 ERF2YLR246W 1080 nt12.14□□□□□ -0.47
APL4Q12028 RNQ1YCL028W 1218 nt12.14□□□□□ -0.47
APL4Q12028 ATF2YGR177C 1608 nt12.11□□□□□ -0.47
APL4Q12028 MIC10YCL057C-A 294 nt12.11□□□□□ -0.47
APL4Q12028 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.07□□□□□ -0.48
APL4Q12028 DIC1YLR348C 897 nt12.04□□□□□ -0.48
APL4Q12028 FTR1YER145C 1215 nt12.03□□□□□ -0.48
APL4Q12028 SNG1YGR197C 1644 nt12.03□□□□□ -0.48
APL4Q12028 BOR1YNL275W 1731 nt12.02□□□□□ -0.49
APL4Q12028 GAL1YBR020W 1587 nt12.01□□□□□ -0.49
APL4Q12028 HEM12YDR047W 1089 nt12.01□□□□□ -0.49
APL4Q12028 SPP1YPL138C 1062 nt12.01□□□□□ -0.49
APL4Q12028 TRM5YHR070W 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
APL4Q12028 HSP60YLR259C 1719 nt11.96□□□□□ -0.49
APL4Q12028 CCA1YER168C 1641 nt11.94□□□□□ -0.5
APL4Q12028 YFL067WYFL067W 528 nt11.94□□□□□ -0.5
APL4Q12028 PTH1YHR189W 573 nt11.94□□□□□ -0.5
APL4Q12028 RAX1YOR301W 1308 nt11.9□□□□□ -0.5
APL4Q12028 DDR2YOL052C-A 186 nt11.88□□□□□ -0.51
APL4Q12028 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.87□□□□□ -0.51
APL4Q12028 FUR4YBR021W 1902 nt11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.7 ms