Protein–RNA interactions for Protein: Q08951

APL5, AP-3 complex subunit delta, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL5Q08951 SIS1YNL007C 1059 nt13.11□□□□□ -0.31
APL5Q08951 NPL3YDR432W 1245 nt13.1□□□□□ -0.31
APL5Q08951 SDH1YKL148C 1923 nt13.09□□□□□ -0.31
APL5Q08951 HOM6YJR139C 1080 nt13.09□□□□□ -0.31
APL5Q08951 YOR139CYOR139C 393 nt13.07□□□□□ -0.32
APL5Q08951 MNP1YGL068W 585 nt13.02□□□□□ -0.33
APL5Q08951 IRC15YPL017C 1500 nt12.98□□□□□ -0.33
APL5Q08951 SCC4YER147C 1875 nt12.95□□□□□ -0.34
APL5Q08951 YOL037CYOL037C 354 nt12.95□□□□□ -0.34
APL5Q08951 ART5YGR068C 1761 nt12.92□□□□□ -0.34
APL5Q08951 RKM5YLR137W 1104 nt12.92□□□□□ -0.34
APL5Q08951 GFD2YCL036W 1701 nt12.91□□□□□ -0.34
APL5Q08951 GIS3YLR094C 1509 nt12.89□□□□□ -0.35
APL5Q08951 PET9YBL030C 957 nt12.85□□□□□ -0.35
APL5Q08951 SEC11YIR022W 504 nt12.8□□□□□ -0.36
APL5Q08951 YCH1YGR203W 447 nt12.79□□□□□ -0.36
APL5Q08951 RTS2YOR077W 699 nt12.79□□□□□ -0.36
APL5Q08951 PCH2YBR186W 1695 nt12.77□□□□□ -0.36
APL5Q08951 TIR4YOR009W 1464 nt12.74□□□□□ -0.37
APL5Q08951 GUT2YIL155C 1950 nt12.71□□□□□ -0.37
APL5Q08951 CUE1YMR264W 612 nt12.7□□□□□ -0.38
APL5Q08951 YSC84YHR016C 1407 nt12.68□□□□□ -0.38
APL5Q08951 YMR057CYMR057C 372 nt12.65□□□□□ -0.38
APL5Q08951 YHL050CYHL050C 2094 nt12.61□□□□□ -0.39
APL5Q08951 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.6□□□□□ -0.39
APL5Q08951 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.6□□□□□ -0.39
APL5Q08951 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.6□□□□□ -0.39
APL5Q08951 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.6□□□□□ -0.39
APL5Q08951 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.6□□□□□ -0.39
APL5Q08951 YLR281CYLR281C 468 nt12.59□□□□□ -0.39
APL5Q08951 YIL100WYIL100W 354 nt12.56□□□□□ -0.4
APL5Q08951 WHI5YOR083W 888 nt12.56□□□□□ -0.4
APL5Q08951 UME6YDR207C 2511 nt12.56□□□□□ -0.4
APL5Q08951 PUS2YGL063W 1113 nt12.55□□□□□ -0.4
APL5Q08951 RRT12YCR045C 1476 nt12.54□□□□□ -0.4
APL5Q08951 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.54□□□□□ -0.4
APL5Q08951 YNL195CYNL195C 786 nt12.54□□□□□ -0.4
APL5Q08951 YJL152WYJL152W 360 nt12.52□□□□□ -0.41
APL5Q08951 PIB2YGL023C 1908 nt12.5□□□□□ -0.41
APL5Q08951 YLR236CYLR236C 324 nt12.5□□□□□ -0.41
APL5Q08951 RTF1YGL244W 1677 nt12.45□□□□□ -0.42
APL5Q08951 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.44□□□□□ -0.42
APL5Q08951 Q0182Q0182 405 nt12.42□□□□□ -0.42
APL5Q08951 BOP3YNL042W 1191 nt12.38□□□□□ -0.43
APL5Q08951 IMP2'YIL154C 1041 nt12.37□□□□□ -0.43
APL5Q08951 DSK2YMR276W 1122 nt12.31□□□□□ -0.44
APL5Q08951 PTK1YKL198C 1989 nt12.25□□□□□ -0.45
APL5Q08951 NCP1YHR042W 2076 nt12.24□□□□□ -0.45
APL5Q08951 FMP45YDL222C 930 nt12.22□□□□□ -0.45
APL5Q08951 YJL225CYJL225C 5277 nt12.21□□□□□ -0.45
APL5Q08951 IDH1YNL037C 1083 nt12.2□□□□□ -0.46
APL5Q08951 MOT3YMR070W 1473 nt12.15□□□□□ -0.46
APL5Q08951 RRD1YIL153W 1182 nt12.15□□□□□ -0.46
APL5Q08951 GBP2YCL011C 1284 nt12.14□□□□□ -0.47
APL5Q08951 YPR011CYPR011C 981 nt12.13□□□□□ -0.47
APL5Q08951 LCB1YMR296C 1677 nt12.11□□□□□ -0.47
APL5Q08951 FMP52YER004W 696 nt12.1□□□□□ -0.47
APL5Q08951 TCD2YKL027W 1344 nt12.07□□□□□ -0.48
APL5Q08951 DED1YOR204W 1815 nt12.06□□□□□ -0.48
APL5Q08951 YDR433WYDR433W 441 nt12.05□□□□□ -0.48
APL5Q08951 YFL054CYFL054C 1941 nt12.01□□□□□ -0.49
APL5Q08951 PCM1YEL058W 1674 nt12.01□□□□□ -0.49
APL5Q08951 ERV46YAL042W 1248 nt11.98□□□□□ -0.49
APL5Q08951 RPM1RPM1 483 nt11.98□□□□□ -0.49
APL5Q08951 SIM1YIL123W 1431 nt11.97□□□□□ -0.49
APL5Q08951 FMT1YBL013W 1206 nt11.97□□□□□ -0.49
APL5Q08951 LPX1YOR084W 1164 nt11.97□□□□□ -0.49
APL5Q08951 YKR040CYKR040C 504 nt11.94□□□□□ -0.5
APL5Q08951 SPT8YLR055C 1809 nt11.93□□□□□ -0.5
APL5Q08951 CWP1YKL096W 720 nt11.91□□□□□ -0.5
APL5Q08951 ADH2YMR303C 1047 nt11.91□□□□□ -0.5
APL5Q08951 MCH5YOR306C 1566 nt11.89□□□□□ -0.51
APL5Q08951 SNF6YHL025W 999 nt11.89□□□□□ -0.51
APL5Q08951 LYS4YDR234W 2082 nt11.88□□□□□ -0.51
APL5Q08951 BIO4YNR057C 714 nt11.86□□□□□ -0.51
APL5Q08951 MXR2YCL033C 507 nt11.86□□□□□ -0.51
APL5Q08951 SOR2YDL246C 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
APL5Q08951 SOR1YJR159W 1074 nt11.85□□□□□ -0.51
APL5Q08951 BOR1YNL275W 1731 nt11.82□□□□□ -0.52
APL5Q08951 YCL042WYCL042W 360 nt11.81□□□□□ -0.52
APL5Q08951 MRPL8YJL063C 717 nt11.77□□□□□ -0.53
APL5Q08951 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.77□□□□□ -0.53
APL5Q08951 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.77□□□□□ -0.53
APL5Q08951 SPP1YPL138C 1062 nt11.75□□□□□ -0.53
APL5Q08951 YIH1YCR059C 777 nt11.74□□□□□ -0.53
APL5Q08951 ERF2YLR246W 1080 nt11.74□□□□□ -0.53
APL5Q08951 SWE1YJL187C 2460 nt11.73□□□□□ -0.53
APL5Q08951 FRD1YEL047C 1413 nt11.72□□□□□ -0.53
APL5Q08951 ADO1YJR105W 1023 nt11.7□□□□□ -0.54
APL5Q08951 CRR1YLR213C 1269 nt11.7□□□□□ -0.54
APL5Q08951 RNQ1YCL028W 1218 nt11.7□□□□□ -0.54
APL5Q08951 YLL053CYLL053C 459 nt11.68□□□□□ -0.54
APL5Q08951 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.63□□□□□ -0.55
APL5Q08951 YEL076CYEL076C 651 nt11.63□□□□□ -0.55
APL5Q08951 YLR464WYLR464W 651 nt11.63□□□□□ -0.55
APL5Q08951 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.6□□□□□ -0.55
APL5Q08951 ATF2YGR177C 1608 nt11.59□□□□□ -0.55
APL5Q08951 HEM12YDR047W 1089 nt11.58□□□□□ -0.56
APL5Q08951 FTR1YER145C 1215 nt11.57□□□□□ -0.56
APL5Q08951 YFL067WYFL067W 528 nt11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms