Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 FIS1YIL065C 468 nt12.73□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 FPR4YLR449W 1179 nt12.73□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.71□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 YEL076CYEL076C 651 nt12.71□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 YLR464WYLR464W 651 nt12.71□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 FUN26YAL022C 1554 nt12.71□□□□□ -0.37
SGO1Q08490 SPP1YPL138C 1062 nt12.67□□□□□ -0.38
SGO1Q08490 LPX1YOR084W 1164 nt12.66□□□□□ -0.38
SGO1Q08490 PHO4YFR034C 939 nt12.65□□□□□ -0.38
SGO1Q08490 RTG1YOL067C 534 nt12.63□□□□□ -0.39
SGO1Q08490 CCT6YDR188W 1641 nt12.62□□□□□ -0.39
SGO1Q08490 BDF1YLR399C 2061 nt12.61□□□□□ -0.39
SGO1Q08490 ERV46YAL042W 1248 nt12.6□□□□□ -0.39
SGO1Q08490 Q0182Q0182 405 nt12.55□□□□□ -0.4
SGO1Q08490 SIS1YNL007C 1059 nt12.54□□□□□ -0.4
SGO1Q08490 YJL152WYJL152W 360 nt12.49□□□□□ -0.41
SGO1Q08490 IDH1YNL037C 1083 nt12.46□□□□□ -0.41
SGO1Q08490 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.44□□□□□ -0.42
SGO1Q08490 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.44□□□□□ -0.42
SGO1Q08490 YDR433WYDR433W 441 nt12.43□□□□□ -0.42
SGO1Q08490 YKR040CYKR040C 504 nt12.41□□□□□ -0.42
SGO1Q08490 TAT1YBR069C 1860 nt12.41□□□□□ -0.42
SGO1Q08490 YDR094WYDR094W 336 nt12.38□□□□□ -0.43
SGO1Q08490 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.38□□□□□ -0.43
SGO1Q08490 ALF1YNL148C 765 nt12.38□□□□□ -0.43
SGO1Q08490 PAC11YDR488C 1602 nt12.36□□□□□ -0.43
SGO1Q08490 HUA1YGR268C 597 nt12.33□□□□□ -0.44
SGO1Q08490 MXR2YCL033C 507 nt12.32□□□□□ -0.44
SGO1Q08490 GBP2YCL011C 1284 nt12.29□□□□□ -0.44
SGO1Q08490 TIR4YOR009W 1464 nt12.24□□□□□ -0.45
SGO1Q08490 MEP2YNL142W 1500 nt12.23□□□□□ -0.45
SGO1Q08490 YPS1YLR120C 1710 nt12.23□□□□□ -0.45
SGO1Q08490 YDR095CYDR095C 411 nt12.21□□□□□ -0.45
SGO1Q08490 CAC2YML102W 1407 nt12.07□□□□□ -0.48
SGO1Q08490 NVJ2YPR091C 2313 nt12.06□□□□□ -0.48
SGO1Q08490 DCW1YKL046C 1350 nt12.06□□□□□ -0.48
SGO1Q08490 SBA1YKL117W 651 nt12.06□□□□□ -0.48
SGO1Q08490 TCD2YKL027W 1344 nt12.05□□□□□ -0.48
SGO1Q08490 FRD1YEL047C 1413 nt12.04□□□□□ -0.48
SGO1Q08490 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.02□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.01□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 YMR057CYMR057C 372 nt12.01□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 PTH1YHR189W 573 nt12□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 ART5YGR068C 1761 nt11.99□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 RPP2AYOL039W 321 nt11.97□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 DED1YOR204W 1815 nt11.97□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 YKL030WYKL030W 606 nt11.96□□□□□ -0.49
SGO1Q08490 YBR220CYBR220C 1683 nt11.94□□□□□ -0.5
SGO1Q08490 PET9YBL030C 957 nt11.94□□□□□ -0.5
SGO1Q08490 PAU16YKL224C 372 nt11.92□□□□□ -0.5
SGO1Q08490 PTP1YDL230W 1008 nt11.9□□□□□ -0.5
SGO1Q08490 YLR235CYLR235C 399 nt11.9□□□□□ -0.5
SGO1Q08490 RRD1YIL153W 1182 nt11.89□□□□□ -0.51
SGO1Q08490 GFD2YCL036W 1701 nt11.89□□□□□ -0.51
SGO1Q08490 LCB1YMR296C 1677 nt11.87□□□□□ -0.51
SGO1Q08490 EMI2YDR516C 1503 nt11.83□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 YCL042WYCL042W 360 nt11.83□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 SOR2YDL246C 1074 nt11.82□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 SOR1YJR159W 1074 nt11.82□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 FMT1YBL013W 1206 nt11.81□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 YFR018CYFR018C 1092 nt11.8□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 PRE6YOL038W 765 nt11.78□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 FPS1YLL043W 2010 nt11.77□□□□□ -0.52
SGO1Q08490 YMR090WYMR090W 684 nt11.77□□□□□ -0.53
SGO1Q08490 RRT5YFR032C 870 nt11.75□□□□□ -0.53
SGO1Q08490 SDH1YKL148C 1923 nt11.71□□□□□ -0.53
SGO1Q08490 PCH2YBR186W 1695 nt11.71□□□□□ -0.54
SGO1Q08490 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.7□□□□□ -0.54
SGO1Q08490 GUT2YIL155C 1950 nt11.69□□□□□ -0.54
SGO1Q08490 YDL221WYDL221W 552 nt11.68□□□□□ -0.54
SGO1Q08490 RTS2YOR077W 699 nt11.68□□□□□ -0.54
SGO1Q08490 TIM23YNR017W 669 nt11.63□□□□□ -0.55
SGO1Q08490 SNF6YHL025W 999 nt11.62□□□□□ -0.55
SGO1Q08490 CWP1YKL096W 720 nt11.6□□□□□ -0.55
SGO1Q08490 DIC1YLR348C 897 nt11.6□□□□□ -0.55
SGO1Q08490 FMP52YER004W 696 nt11.58□□□□□ -0.56
SGO1Q08490 SEC11YIR022W 504 nt11.57□□□□□ -0.56
SGO1Q08490 ADH2YMR303C 1047 nt11.57□□□□□ -0.56
SGO1Q08490 CUE1YMR264W 612 nt11.54□□□□□ -0.56
SGO1Q08490 PIB2YGL023C 1908 nt11.53□□□□□ -0.56
SGO1Q08490 YLR179CYLR179C 606 nt11.52□□□□□ -0.57
SGO1Q08490 YPR064WYPR064W 420 nt11.51□□□□□ -0.57
SGO1Q08490 IRC15YPL017C 1500 nt11.5□□□□□ -0.57
SGO1Q08490 SCC4YER147C 1875 nt11.5□□□□□ -0.57
SGO1Q08490 YFL066CYFL066C 1179 nt11.48□□□□□ -0.57
SGO1Q08490 TAD3YLR316C 969 nt11.47□□□□□ -0.57
SGO1Q08490 NAT4YMR069W 858 nt11.45□□□□□ -0.58
SGO1Q08490 WSC2YNL283C 1512 nt11.45□□□□□ -0.58
SGO1Q08490 PEX25YPL112C 1185 nt11.42□□□□□ -0.58
SGO1Q08490 AHT1YHR093W 549 nt11.4□□□□□ -0.58
SGO1Q08490 GIS3YLR094C 1509 nt11.39□□□□□ -0.59
SGO1Q08490 PCM1YEL058W 1674 nt11.36□□□□□ -0.59
SGO1Q08490 YIL100WYIL100W 354 nt11.36□□□□□ -0.59
SGO1Q08490 YSC84YHR016C 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
SGO1Q08490 RNQ1YCL028W 1218 nt11.35□□□□□ -0.59
SGO1Q08490 RTF1YGL244W 1677 nt11.33□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 GLK1YCL040W 1503 nt11.33□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 YIH1YCR059C 777 nt11.32□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 YMR244WYMR244W 1068 nt11.32□□□□□ -0.6
SGO1Q08490 MSF1YPR047W 1410 nt11.32□□□□□ -0.6
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