Protein–RNA interactions for Protein: Q08223

AIM39, Altered inheritance of mitochondria protein 39, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AIM39Q08223 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.81□□□□□ -0.36
AIM39Q08223 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.81□□□□□ -0.36
AIM39Q08223 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.81□□□□□ -0.36
AIM39Q08223 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.81□□□□□ -0.36
AIM39Q08223 SSA4YER103W 1929 nt12.79□□□□□ -0.36
AIM39Q08223 CAC2YML102W 1407 nt12.76□□□□□ -0.37
AIM39Q08223 PUS2YGL063W 1113 nt12.75□□□□□ -0.37
AIM39Q08223 ART5YGR068C 1761 nt12.74□□□□□ -0.37
AIM39Q08223 EMI2YDR516C 1503 nt12.73□□□□□ -0.37
AIM39Q08223 TIR4YOR009W 1464 nt12.73□□□□□ -0.37
AIM39Q08223 YJL152WYJL152W 360 nt12.73□□□□□ -0.37
AIM39Q08223 GFD2YCL036W 1701 nt12.69□□□□□ -0.38
AIM39Q08223 PET9YBL030C 957 nt12.68□□□□□ -0.38
AIM39Q08223 YCH1YGR203W 447 nt12.66□□□□□ -0.38
AIM39Q08223 YMR090WYMR090W 684 nt12.65□□□□□ -0.38
AIM39Q08223 YDL221WYDL221W 552 nt12.64□□□□□ -0.39
AIM39Q08223 YMR057CYMR057C 372 nt12.6□□□□□ -0.39
AIM39Q08223 DSK2YMR276W 1122 nt12.58□□□□□ -0.4
AIM39Q08223 IRC15YPL017C 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
AIM39Q08223 IMP2'YIL154C 1041 nt12.56□□□□□ -0.4
AIM39Q08223 RTS2YOR077W 699 nt12.55□□□□□ -0.4
AIM39Q08223 YLR236CYLR236C 324 nt12.53□□□□□ -0.4
AIM39Q08223 YPR011CYPR011C 981 nt12.53□□□□□ -0.4
AIM39Q08223 IDH1YNL037C 1083 nt12.51□□□□□ -0.41
AIM39Q08223 GIS3YLR094C 1509 nt12.48□□□□□ -0.41
AIM39Q08223 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.48□□□□□ -0.41
AIM39Q08223 YBR220CYBR220C 1683 nt12.48□□□□□ -0.41
AIM39Q08223 SDH1YKL148C 1923 nt12.47□□□□□ -0.41
AIM39Q08223 FMP45YDL222C 930 nt12.44□□□□□ -0.42
AIM39Q08223 CUE1YMR264W 612 nt12.43□□□□□ -0.42
AIM39Q08223 FPS1YLL043W 2010 nt12.42□□□□□ -0.42
AIM39Q08223 SCC4YER147C 1875 nt12.41□□□□□ -0.42
AIM39Q08223 GBP2YCL011C 1284 nt12.41□□□□□ -0.42
AIM39Q08223 YDR433WYDR433W 441 nt12.35□□□□□ -0.43
AIM39Q08223 LPX1YOR084W 1164 nt12.32□□□□□ -0.44
AIM39Q08223 ERV46YAL042W 1248 nt12.31□□□□□ -0.44
AIM39Q08223 MOT3YMR070W 1473 nt12.29□□□□□ -0.44
AIM39Q08223 YIL100WYIL100W 354 nt12.28□□□□□ -0.44
AIM39Q08223 TCD2YKL027W 1344 nt12.27□□□□□ -0.45
AIM39Q08223 BDF1YLR399C 2061 nt12.26□□□□□ -0.45
AIM39Q08223 MXR2YCL033C 507 nt12.25□□□□□ -0.45
AIM39Q08223 RRD1YIL153W 1182 nt12.24□□□□□ -0.45
AIM39Q08223 YKR040CYKR040C 504 nt12.23□□□□□ -0.45
AIM39Q08223 DED1YOR204W 1815 nt12.2□□□□□ -0.46
AIM39Q08223 YNL195CYNL195C 786 nt12.12□□□□□ -0.47
AIM39Q08223 TAT1YBR069C 1860 nt12.11□□□□□ -0.47
AIM39Q08223 YSC84YHR016C 1407 nt12.1□□□□□ -0.47
AIM39Q08223 FMT1YBL013W 1206 nt12.09□□□□□ -0.47
AIM39Q08223 RRT12YCR045C 1476 nt12.08□□□□□ -0.47
AIM39Q08223 SPP1YPL138C 1062 nt12.08□□□□□ -0.48
AIM39Q08223 FMP52YER004W 696 nt12.07□□□□□ -0.48
AIM39Q08223 YHL050CYHL050C 2094 nt12.04□□□□□ -0.48
AIM39Q08223 FRD1YEL047C 1413 nt12.03□□□□□ -0.48
AIM39Q08223 YCL042WYCL042W 360 nt12.03□□□□□ -0.48
AIM39Q08223 SEC11YIR022W 504 nt12.02□□□□□ -0.49
AIM39Q08223 SOR2YDL246C 1074 nt12.01□□□□□ -0.49
AIM39Q08223 SOR1YJR159W 1074 nt12.01□□□□□ -0.49
AIM39Q08223 CWP1YKL096W 720 nt11.99□□□□□ -0.49
AIM39Q08223 ADH2YMR303C 1047 nt11.96□□□□□ -0.49
AIM39Q08223 PCM1YEL058W 1674 nt11.94□□□□□ -0.5
AIM39Q08223 PCH2YBR186W 1695 nt11.94□□□□□ -0.5
AIM39Q08223 SNF6YHL025W 999 nt11.88□□□□□ -0.51
AIM39Q08223 GUT2YIL155C 1950 nt11.87□□□□□ -0.51
AIM39Q08223 PTH1YHR189W 573 nt11.84□□□□□ -0.51
AIM39Q08223 RTG1YOL067C 534 nt11.82□□□□□ -0.52
AIM39Q08223 MRPL8YJL063C 717 nt11.79□□□□□ -0.52
AIM39Q08223 YLR235CYLR235C 399 nt11.78□□□□□ -0.52
AIM39Q08223 SIM1YIL123W 1431 nt11.77□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.76□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 YEL076CYEL076C 651 nt11.76□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 YLR464WYLR464W 651 nt11.76□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 LCB1YMR296C 1677 nt11.75□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 YIH1YCR059C 777 nt11.75□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 DIC1YLR348C 897 nt11.74□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 RNQ1YCL028W 1218 nt11.74□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 BIO4YNR057C 714 nt11.73□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 YKL030WYKL030W 606 nt11.72□□□□□ -0.53
AIM39Q08223 RTF1YGL244W 1677 nt11.7□□□□□ -0.54
AIM39Q08223 ADO1YJR105W 1023 nt11.69□□□□□ -0.54
AIM39Q08223 BOP3YNL042W 1191 nt11.69□□□□□ -0.54
AIM39Q08223 NCP1YHR042W 2076 nt11.69□□□□□ -0.54
AIM39Q08223 PIB2YGL023C 1908 nt11.68□□□□□ -0.54
AIM39Q08223 YLL053CYLL053C 459 nt11.66□□□□□ -0.54
AIM39Q08223 TIM23YNR017W 669 nt11.65□□□□□ -0.54
AIM39Q08223 HUA1YGR268C 597 nt11.63□□□□□ -0.55
AIM39Q08223 YLR179CYLR179C 606 nt11.6□□□□□ -0.55
AIM39Q08223 FTR1YER145C 1215 nt11.57□□□□□ -0.56
AIM39Q08223 ERF2YLR246W 1080 nt11.55□□□□□ -0.56
AIM39Q08223 GAL1YBR020W 1587 nt11.54□□□□□ -0.56
AIM39Q08223 PTK1YKL198C 1989 nt11.52□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 TRM5YHR070W 1500 nt11.51□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 ATF2YGR177C 1608 nt11.5□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 CRR1YLR213C 1269 nt11.5□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 AQY1YPR192W 918 nt11.5□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 LYS4YDR234W 2082 nt11.5□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 YPR064WYPR064W 420 nt11.49□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 WSC2YNL283C 1512 nt11.48□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 YFL067WYFL067W 528 nt11.47□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 AHT1YHR093W 549 nt11.47□□□□□ -0.57
AIM39Q08223 DDR2YOL052C-A 186 nt11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms